Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E2

Plod1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod1Q9R0E2 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Plod1Q9R0E2 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Plod1Q9R0E2 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Plod1Q9R0E2 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Plod1Q9R0E2 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Plod1Q9R0E2 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Plod1Q9R0E2 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Plod1Q9R0E2 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Plod1Q9R0E2 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Plod1Q9R0E2 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Plod1Q9R0E2 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Plod1Q9R0E2 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Plod1Q9R0E2 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Plod1Q9R0E2 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Plod1Q9R0E2 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Plod1Q9R0E2 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Plod1Q9R0E2 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Plod1Q9R0E2 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Plod1Q9R0E2 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Plod1Q9R0E2 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Plod1Q9R0E2 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Plod1Q9R0E2 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Plod1Q9R0E2 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Plod1Q9R0E2 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Plod1Q9R0E2 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Plod1Q9R0E2 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Plod1Q9R0E2 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Plod1Q9R0E2 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Plod1Q9R0E2 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Plod1Q9R0E2 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Plod1Q9R0E2 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Plod1Q9R0E2 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Plod1Q9R0E2 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Plod1Q9R0E2 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Plod1Q9R0E2 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Plod1Q9R0E2 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Plod1Q9R0E2 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Plod1Q9R0E2 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Plod1Q9R0E2 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Plod1Q9R0E2 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Plod1Q9R0E2 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Plod1Q9R0E2 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Plod1Q9R0E2 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Plod1Q9R0E2 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Plod1Q9R0E2 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Plod1Q9R0E2 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Plod1Q9R0E2 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Plod1Q9R0E2 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Plod1Q9R0E2 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Plod1Q9R0E2 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Plod1Q9R0E2 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Plod1Q9R0E2 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Plod1Q9R0E2 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Plod1Q9R0E2 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Plod1Q9R0E2 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Plod1Q9R0E2 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Plod1Q9R0E2 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Plod1Q9R0E2 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Plod1Q9R0E2 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Plod1Q9R0E2 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Plod1Q9R0E2 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Plod1Q9R0E2 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Plod1Q9R0E2 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Plod1Q9R0E2 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Plod1Q9R0E2 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Plod1Q9R0E2 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Plod1Q9R0E2 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Plod1Q9R0E2 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Plod1Q9R0E2 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Plod1Q9R0E2 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Plod1Q9R0E2 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Plod1Q9R0E2 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Plod1Q9R0E2 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Plod1Q9R0E2 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Plod1Q9R0E2 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Plod1Q9R0E2 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Plod1Q9R0E2 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Plod1Q9R0E2 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Plod1Q9R0E2 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Plod1Q9R0E2 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Plod1Q9R0E2 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Plod1Q9R0E2 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Plod1Q9R0E2 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Plod1Q9R0E2 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Plod1Q9R0E2 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Plod1Q9R0E2 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Plod1Q9R0E2 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Plod1Q9R0E2 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Plod1Q9R0E2 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Plod1Q9R0E2 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Plod1Q9R0E2 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Plod1Q9R0E2 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Plod1Q9R0E2 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Plod1Q9R0E2 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Plod1Q9R0E2 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Plod1Q9R0E2 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Plod1Q9R0E2 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Plod1Q9R0E2 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Plod1Q9R0E2 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Plod1Q9R0E2 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms