Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B9

Plod2, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 2, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod2Q9R0B9 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Plod2Q9R0B9 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Plod2Q9R0B9 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Plod2Q9R0B9 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Plod2Q9R0B9 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Plod2Q9R0B9 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Plod2Q9R0B9 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Plod2Q9R0B9 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Plod2Q9R0B9 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Plod2Q9R0B9 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Plod2Q9R0B9 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Plod2Q9R0B9 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Plod2Q9R0B9 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Plod2Q9R0B9 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Plod2Q9R0B9 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Plod2Q9R0B9 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Plod2Q9R0B9 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Plod2Q9R0B9 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Plod2Q9R0B9 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Plod2Q9R0B9 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Plod2Q9R0B9 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Plod2Q9R0B9 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Plod2Q9R0B9 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Plod2Q9R0B9 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Plod2Q9R0B9 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Plod2Q9R0B9 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Plod2Q9R0B9 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Plod2Q9R0B9 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Plod2Q9R0B9 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Plod2Q9R0B9 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Plod2Q9R0B9 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Plod2Q9R0B9 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Plod2Q9R0B9 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Plod2Q9R0B9 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Plod2Q9R0B9 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Plod2Q9R0B9 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Plod2Q9R0B9 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Plod2Q9R0B9 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Plod2Q9R0B9 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Plod2Q9R0B9 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Plod2Q9R0B9 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Plod2Q9R0B9 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Plod2Q9R0B9 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Plod2Q9R0B9 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Plod2Q9R0B9 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Plod2Q9R0B9 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Plod2Q9R0B9 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Plod2Q9R0B9 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Plod2Q9R0B9 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Plod2Q9R0B9 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Plod2Q9R0B9 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Plod2Q9R0B9 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Plod2Q9R0B9 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Plod2Q9R0B9 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Plod2Q9R0B9 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Plod2Q9R0B9 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Plod2Q9R0B9 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Plod2Q9R0B9 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Plod2Q9R0B9 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Plod2Q9R0B9 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Plod2Q9R0B9 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Plod2Q9R0B9 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Plod2Q9R0B9 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Plod2Q9R0B9 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Plod2Q9R0B9 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Plod2Q9R0B9 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Plod2Q9R0B9 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Plod2Q9R0B9 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Plod2Q9R0B9 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Plod2Q9R0B9 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Plod2Q9R0B9 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Plod2Q9R0B9 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Plod2Q9R0B9 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Plod2Q9R0B9 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Plod2Q9R0B9 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Plod2Q9R0B9 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Plod2Q9R0B9 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Plod2Q9R0B9 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Plod2Q9R0B9 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Plod2Q9R0B9 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Plod2Q9R0B9 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Plod2Q9R0B9 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Plod2Q9R0B9 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Plod2Q9R0B9 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Plod2Q9R0B9 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Plod2Q9R0B9 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Plod2Q9R0B9 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Plod2Q9R0B9 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Plod2Q9R0B9 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Plod2Q9R0B9 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Plod2Q9R0B9 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Plod2Q9R0B9 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Plod2Q9R0B9 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Plod2Q9R0B9 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Plod2Q9R0B9 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Plod2Q9R0B9 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Plod2Q9R0B9 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Plod2Q9R0B9 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Plod2Q9R0B9 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Plod2Q9R0B9 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms