Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0A5

Nek3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, mousemouse

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Length 511 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek3Q9R0A5 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nek3Q9R0A5 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nek3Q9R0A5 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nek3Q9R0A5 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nek3Q9R0A5 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nek3Q9R0A5 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nek3Q9R0A5 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nek3Q9R0A5 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nek3Q9R0A5 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nek3Q9R0A5 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nek3Q9R0A5 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nek3Q9R0A5 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nek3Q9R0A5 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nek3Q9R0A5 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nek3Q9R0A5 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nek3Q9R0A5 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Nek3Q9R0A5 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nek3Q9R0A5 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nek3Q9R0A5 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nek3Q9R0A5 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nek3Q9R0A5 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nek3Q9R0A5 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nek3Q9R0A5 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nek3Q9R0A5 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nek3Q9R0A5 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nek3Q9R0A5 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nek3Q9R0A5 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nek3Q9R0A5 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nek3Q9R0A5 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nek3Q9R0A5 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nek3Q9R0A5 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nek3Q9R0A5 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nek3Q9R0A5 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nek3Q9R0A5 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nek3Q9R0A5 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nek3Q9R0A5 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nek3Q9R0A5 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nek3Q9R0A5 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nek3Q9R0A5 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nek3Q9R0A5 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nek3Q9R0A5 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nek3Q9R0A5 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nek3Q9R0A5 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nek3Q9R0A5 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nek3Q9R0A5 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nek3Q9R0A5 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nek3Q9R0A5 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nek3Q9R0A5 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nek3Q9R0A5 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nek3Q9R0A5 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nek3Q9R0A5 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nek3Q9R0A5 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nek3Q9R0A5 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nek3Q9R0A5 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Nek3Q9R0A5 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Nek3Q9R0A5 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Nek3Q9R0A5 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nek3Q9R0A5 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nek3Q9R0A5 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nek3Q9R0A5 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nek3Q9R0A5 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
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Nek3Q9R0A5 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nek3Q9R0A5 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nek3Q9R0A5 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nek3Q9R0A5 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nek3Q9R0A5 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nek3Q9R0A5 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nek3Q9R0A5 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nek3Q9R0A5 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nek3Q9R0A5 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nek3Q9R0A5 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nek3Q9R0A5 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nek3Q9R0A5 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nek3Q9R0A5 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nek3Q9R0A5 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nek3Q9R0A5 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nek3Q9R0A5 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nek3Q9R0A5 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nek3Q9R0A5 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nek3Q9R0A5 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nek3Q9R0A5 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Nek3Q9R0A5 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Nek3Q9R0A5 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nek3Q9R0A5 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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