Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS8

Sh2d3c, SH2 domain-containing protein 3C, mousemouse

Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d3cQ9QZS8 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sh2d3cQ9QZS8 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sh2d3cQ9QZS8 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sh2d3cQ9QZS8 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sh2d3cQ9QZS8 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sh2d3cQ9QZS8 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sh2d3cQ9QZS8 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sh2d3cQ9QZS8 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sh2d3cQ9QZS8 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sh2d3cQ9QZS8 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.7 ms