Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZM0

Ubqln2, Ubiquilin-2, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubqln2Q9QZM0 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ubqln2Q9QZM0 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ubqln2Q9QZM0 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ubqln2Q9QZM0 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ubqln2Q9QZM0 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ubqln2Q9QZM0 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ubqln2Q9QZM0 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ubqln2Q9QZM0 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ubqln2Q9QZM0 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ubqln2Q9QZM0 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ubqln2Q9QZM0 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ubqln2Q9QZM0 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ubqln2Q9QZM0 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ubqln2Q9QZM0 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ubqln2Q9QZM0 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ubqln2Q9QZM0 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ubqln2Q9QZM0 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubqln2Q9QZM0 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubqln2Q9QZM0 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubqln2Q9QZM0 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubqln2Q9QZM0 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubqln2Q9QZM0 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubqln2Q9QZM0 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubqln2Q9QZM0 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubqln2Q9QZM0 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubqln2Q9QZM0 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubqln2Q9QZM0 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubqln2Q9QZM0 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubqln2Q9QZM0 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubqln2Q9QZM0 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubqln2Q9QZM0 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubqln2Q9QZM0 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubqln2Q9QZM0 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubqln2Q9QZM0 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubqln2Q9QZM0 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubqln2Q9QZM0 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubqln2Q9QZM0 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubqln2Q9QZM0 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubqln2Q9QZM0 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubqln2Q9QZM0 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubqln2Q9QZM0 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubqln2Q9QZM0 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubqln2Q9QZM0 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubqln2Q9QZM0 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubqln2Q9QZM0 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubqln2Q9QZM0 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubqln2Q9QZM0 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubqln2Q9QZM0 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubqln2Q9QZM0 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubqln2Q9QZM0 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubqln2Q9QZM0 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubqln2Q9QZM0 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubqln2Q9QZM0 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubqln2Q9QZM0 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubqln2Q9QZM0 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubqln2Q9QZM0 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubqln2Q9QZM0 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubqln2Q9QZM0 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubqln2Q9QZM0 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubqln2Q9QZM0 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubqln2Q9QZM0 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubqln2Q9QZM0 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubqln2Q9QZM0 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubqln2Q9QZM0 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubqln2Q9QZM0 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubqln2Q9QZM0 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubqln2Q9QZM0 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubqln2Q9QZM0 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubqln2Q9QZM0 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubqln2Q9QZM0 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubqln2Q9QZM0 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubqln2Q9QZM0 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubqln2Q9QZM0 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubqln2Q9QZM0 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubqln2Q9QZM0 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubqln2Q9QZM0 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubqln2Q9QZM0 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubqln2Q9QZM0 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubqln2Q9QZM0 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubqln2Q9QZM0 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubqln2Q9QZM0 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubqln2Q9QZM0 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubqln2Q9QZM0 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubqln2Q9QZM0 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubqln2Q9QZM0 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubqln2Q9QZM0 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubqln2Q9QZM0 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubqln2Q9QZM0 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubqln2Q9QZM0 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubqln2Q9QZM0 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubqln2Q9QZM0 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubqln2Q9QZM0 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubqln2Q9QZM0 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubqln2Q9QZM0 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubqln2Q9QZM0 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubqln2Q9QZM0 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubqln2Q9QZM0 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubqln2Q9QZM0 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubqln2Q9QZM0 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubqln2Q9QZM0 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms