Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZL6

Usp21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 21, mousemouse

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Length 566 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp21Q9QZL6 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp21Q9QZL6 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp21Q9QZL6 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp21Q9QZL6 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp21Q9QZL6 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp21Q9QZL6 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp21Q9QZL6 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp21Q9QZL6 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp21Q9QZL6 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp21Q9QZL6 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp21Q9QZL6 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp21Q9QZL6 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp21Q9QZL6 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp21Q9QZL6 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp21Q9QZL6 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp21Q9QZL6 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp21Q9QZL6 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp21Q9QZL6 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Usp21Q9QZL6 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Usp21Q9QZL6 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Usp21Q9QZL6 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Usp21Q9QZL6 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Usp21Q9QZL6 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Usp21Q9QZL6 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Usp21Q9QZL6 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp21Q9QZL6 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp21Q9QZL6 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp21Q9QZL6 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp21Q9QZL6 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp21Q9QZL6 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp21Q9QZL6 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp21Q9QZL6 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp21Q9QZL6 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp21Q9QZL6 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp21Q9QZL6 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp21Q9QZL6 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp21Q9QZL6 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp21Q9QZL6 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp21Q9QZL6 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp21Q9QZL6 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp21Q9QZL6 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp21Q9QZL6 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp21Q9QZL6 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp21Q9QZL6 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp21Q9QZL6 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp21Q9QZL6 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp21Q9QZL6 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp21Q9QZL6 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp21Q9QZL6 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp21Q9QZL6 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp21Q9QZL6 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp21Q9QZL6 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp21Q9QZL6 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp21Q9QZL6 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp21Q9QZL6 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp21Q9QZL6 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp21Q9QZL6 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp21Q9QZL6 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp21Q9QZL6 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp21Q9QZL6 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp21Q9QZL6 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp21Q9QZL6 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp21Q9QZL6 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
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Usp21Q9QZL6 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
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Usp21Q9QZL6 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
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Usp21Q9QZL6 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
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Usp21Q9QZL6 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp21Q9QZL6 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp21Q9QZL6 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp21Q9QZL6 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp21Q9QZL6 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
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Usp21Q9QZL6 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp21Q9QZL6 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp21Q9QZL6 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp21Q9QZL6 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp21Q9QZL6 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp21Q9QZL6 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp21Q9QZL6 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp21Q9QZL6 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp21Q9QZL6 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp21Q9QZL6 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp21Q9QZL6 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp21Q9QZL6 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp21Q9QZL6 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp21Q9QZL6 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp21Q9QZL6 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp21Q9QZL6 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp21Q9QZL6 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp21Q9QZL6 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp21Q9QZL6 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp21Q9QZL6 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp21Q9QZL6 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms