Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZE5

Copg1, Coatomer subunit gamma-1, mousemouse

Predictions only

Length 874 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copg1Q9QZE5 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Copg1Q9QZE5 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Copg1Q9QZE5 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Copg1Q9QZE5 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Copg1Q9QZE5 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Copg1Q9QZE5 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Copg1Q9QZE5 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Copg1Q9QZE5 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Copg1Q9QZE5 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Copg1Q9QZE5 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Copg1Q9QZE5 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Copg1Q9QZE5 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Copg1Q9QZE5 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Copg1Q9QZE5 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Copg1Q9QZE5 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Copg1Q9QZE5 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Copg1Q9QZE5 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Copg1Q9QZE5 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Copg1Q9QZE5 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Copg1Q9QZE5 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Copg1Q9QZE5 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Copg1Q9QZE5 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Copg1Q9QZE5 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Copg1Q9QZE5 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Copg1Q9QZE5 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Copg1Q9QZE5 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Copg1Q9QZE5 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Copg1Q9QZE5 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Copg1Q9QZE5 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Copg1Q9QZE5 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Copg1Q9QZE5 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Copg1Q9QZE5 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Copg1Q9QZE5 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Copg1Q9QZE5 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Copg1Q9QZE5 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Copg1Q9QZE5 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Copg1Q9QZE5 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Copg1Q9QZE5 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Copg1Q9QZE5 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Copg1Q9QZE5 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Copg1Q9QZE5 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Copg1Q9QZE5 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Copg1Q9QZE5 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Copg1Q9QZE5 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Copg1Q9QZE5 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Copg1Q9QZE5 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Copg1Q9QZE5 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Copg1Q9QZE5 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Copg1Q9QZE5 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Copg1Q9QZE5 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Copg1Q9QZE5 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Copg1Q9QZE5 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Copg1Q9QZE5 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Copg1Q9QZE5 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Copg1Q9QZE5 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Copg1Q9QZE5 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Copg1Q9QZE5 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Copg1Q9QZE5 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Copg1Q9QZE5 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Copg1Q9QZE5 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Copg1Q9QZE5 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Copg1Q9QZE5 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Copg1Q9QZE5 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Copg1Q9QZE5 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Copg1Q9QZE5 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Copg1Q9QZE5 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Copg1Q9QZE5 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Copg1Q9QZE5 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Copg1Q9QZE5 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Copg1Q9QZE5 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Copg1Q9QZE5 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Copg1Q9QZE5 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Copg1Q9QZE5 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Copg1Q9QZE5 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Copg1Q9QZE5 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Copg1Q9QZE5 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Copg1Q9QZE5 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Copg1Q9QZE5 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Copg1Q9QZE5 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Copg1Q9QZE5 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Copg1Q9QZE5 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Copg1Q9QZE5 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Copg1Q9QZE5 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Copg1Q9QZE5 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Copg1Q9QZE5 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Copg1Q9QZE5 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Copg1Q9QZE5 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Copg1Q9QZE5 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Copg1Q9QZE5 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Copg1Q9QZE5 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Copg1Q9QZE5 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Copg1Q9QZE5 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Copg1Q9QZE5 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Copg1Q9QZE5 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Copg1Q9QZE5 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Copg1Q9QZE5 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Copg1Q9QZE5 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Copg1Q9QZE5 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Copg1Q9QZE5 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Copg1Q9QZE5 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms