Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY76

Vapb, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapbQ9QY76 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VapbQ9QY76 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VapbQ9QY76 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VapbQ9QY76 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VapbQ9QY76 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VapbQ9QY76 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VapbQ9QY76 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VapbQ9QY76 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VapbQ9QY76 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VapbQ9QY76 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VapbQ9QY76 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VapbQ9QY76 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VapbQ9QY76 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VapbQ9QY76 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VapbQ9QY76 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VapbQ9QY76 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
VapbQ9QY76 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VapbQ9QY76 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
VapbQ9QY76 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VapbQ9QY76 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VapbQ9QY76 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VapbQ9QY76 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VapbQ9QY76 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VapbQ9QY76 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VapbQ9QY76 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VapbQ9QY76 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VapbQ9QY76 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VapbQ9QY76 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VapbQ9QY76 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VapbQ9QY76 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VapbQ9QY76 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VapbQ9QY76 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
VapbQ9QY76 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VapbQ9QY76 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VapbQ9QY76 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VapbQ9QY76 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VapbQ9QY76 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
VapbQ9QY76 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VapbQ9QY76 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VapbQ9QY76 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
VapbQ9QY76 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
VapbQ9QY76 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VapbQ9QY76 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VapbQ9QY76 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VapbQ9QY76 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VapbQ9QY76 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VapbQ9QY76 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VapbQ9QY76 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VapbQ9QY76 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
VapbQ9QY76 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
VapbQ9QY76 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VapbQ9QY76 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VapbQ9QY76 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VapbQ9QY76 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VapbQ9QY76 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VapbQ9QY76 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VapbQ9QY76 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VapbQ9QY76 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VapbQ9QY76 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VapbQ9QY76 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VapbQ9QY76 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
VapbQ9QY76 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
VapbQ9QY76 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VapbQ9QY76 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VapbQ9QY76 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VapbQ9QY76 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VapbQ9QY76 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VapbQ9QY76 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VapbQ9QY76 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VapbQ9QY76 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VapbQ9QY76 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VapbQ9QY76 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VapbQ9QY76 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VapbQ9QY76 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VapbQ9QY76 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VapbQ9QY76 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VapbQ9QY76 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VapbQ9QY76 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VapbQ9QY76 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VapbQ9QY76 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VapbQ9QY76 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VapbQ9QY76 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VapbQ9QY76 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VapbQ9QY76 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VapbQ9QY76 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VapbQ9QY76 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VapbQ9QY76 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VapbQ9QY76 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VapbQ9QY76 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VapbQ9QY76 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
VapbQ9QY76 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VapbQ9QY76 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VapbQ9QY76 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VapbQ9QY76 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VapbQ9QY76 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VapbQ9QY76 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VapbQ9QY76 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VapbQ9QY76 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VapbQ9QY76 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VapbQ9QY76 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.5 ms