Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY53

Nphp1, Nephrocystin-1, mousemouse

Predictions only

Length 687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp1Q9QY53 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Nphp1Q9QY53 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nphp1Q9QY53 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Nphp1Q9QY53 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nphp1Q9QY53 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nphp1Q9QY53 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nphp1Q9QY53 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nphp1Q9QY53 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nphp1Q9QY53 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nphp1Q9QY53 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nphp1Q9QY53 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nphp1Q9QY53 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nphp1Q9QY53 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nphp1Q9QY53 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nphp1Q9QY53 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nphp1Q9QY53 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nphp1Q9QY53 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nphp1Q9QY53 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nphp1Q9QY53 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nphp1Q9QY53 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nphp1Q9QY53 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nphp1Q9QY53 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nphp1Q9QY53 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nphp1Q9QY53 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nphp1Q9QY53 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nphp1Q9QY53 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nphp1Q9QY53 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nphp1Q9QY53 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nphp1Q9QY53 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nphp1Q9QY53 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nphp1Q9QY53 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nphp1Q9QY53 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nphp1Q9QY53 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nphp1Q9QY53 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nphp1Q9QY53 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nphp1Q9QY53 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nphp1Q9QY53 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nphp1Q9QY53 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nphp1Q9QY53 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nphp1Q9QY53 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nphp1Q9QY53 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nphp1Q9QY53 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nphp1Q9QY53 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nphp1Q9QY53 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Nphp1Q9QY53 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Nphp1Q9QY53 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nphp1Q9QY53 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nphp1Q9QY53 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nphp1Q9QY53 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nphp1Q9QY53 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nphp1Q9QY53 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nphp1Q9QY53 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nphp1Q9QY53 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nphp1Q9QY53 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nphp1Q9QY53 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nphp1Q9QY53 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Nphp1Q9QY53 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nphp1Q9QY53 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nphp1Q9QY53 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nphp1Q9QY53 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nphp1Q9QY53 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nphp1Q9QY53 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nphp1Q9QY53 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nphp1Q9QY53 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nphp1Q9QY53 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nphp1Q9QY53 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nphp1Q9QY53 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nphp1Q9QY53 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nphp1Q9QY53 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nphp1Q9QY53 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nphp1Q9QY53 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nphp1Q9QY53 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nphp1Q9QY53 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nphp1Q9QY53 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nphp1Q9QY53 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nphp1Q9QY53 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nphp1Q9QY53 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nphp1Q9QY53 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nphp1Q9QY53 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nphp1Q9QY53 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nphp1Q9QY53 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nphp1Q9QY53 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nphp1Q9QY53 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nphp1Q9QY53 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nphp1Q9QY53 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Nphp1Q9QY53 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nphp1Q9QY53 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nphp1Q9QY53 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nphp1Q9QY53 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nphp1Q9QY53 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nphp1Q9QY53 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nphp1Q9QY53 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nphp1Q9QY53 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nphp1Q9QY53 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nphp1Q9QY53 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nphp1Q9QY53 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nphp1Q9QY53 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nphp1Q9QY53 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nphp1Q9QY53 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nphp1Q9QY53 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms