Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY14

Foxe3, Forkhead box protein E3, mousemouse

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxe3Q9QY14 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Foxe3Q9QY14 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Foxe3Q9QY14 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Foxe3Q9QY14 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Foxe3Q9QY14 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Foxe3Q9QY14 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Foxe3Q9QY14 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Foxe3Q9QY14 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Foxe3Q9QY14 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Foxe3Q9QY14 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Foxe3Q9QY14 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Foxe3Q9QY14 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Foxe3Q9QY14 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Foxe3Q9QY14 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Foxe3Q9QY14 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Foxe3Q9QY14 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Foxe3Q9QY14 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Foxe3Q9QY14 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Foxe3Q9QY14 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Foxe3Q9QY14 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Foxe3Q9QY14 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Foxe3Q9QY14 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Foxe3Q9QY14 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Foxe3Q9QY14 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Foxe3Q9QY14 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Foxe3Q9QY14 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Foxe3Q9QY14 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Foxe3Q9QY14 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Foxe3Q9QY14 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Foxe3Q9QY14 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Foxe3Q9QY14 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Foxe3Q9QY14 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Foxe3Q9QY14 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Foxe3Q9QY14 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Foxe3Q9QY14 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Foxe3Q9QY14 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Foxe3Q9QY14 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Foxe3Q9QY14 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Foxe3Q9QY14 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Foxe3Q9QY14 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Foxe3Q9QY14 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Foxe3Q9QY14 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Foxe3Q9QY14 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Foxe3Q9QY14 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Foxe3Q9QY14 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Foxe3Q9QY14 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Foxe3Q9QY14 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Foxe3Q9QY14 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Foxe3Q9QY14 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Foxe3Q9QY14 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Foxe3Q9QY14 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Foxe3Q9QY14 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Foxe3Q9QY14 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Foxe3Q9QY14 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Foxe3Q9QY14 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Foxe3Q9QY14 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Foxe3Q9QY14 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Foxe3Q9QY14 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Foxe3Q9QY14 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Foxe3Q9QY14 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Foxe3Q9QY14 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Foxe3Q9QY14 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Foxe3Q9QY14 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Foxe3Q9QY14 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Foxe3Q9QY14 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Foxe3Q9QY14 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Foxe3Q9QY14 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Foxe3Q9QY14 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Foxe3Q9QY14 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Foxe3Q9QY14 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Foxe3Q9QY14 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Foxe3Q9QY14 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Foxe3Q9QY14 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Foxe3Q9QY14 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Foxe3Q9QY14 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Foxe3Q9QY14 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Foxe3Q9QY14 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Foxe3Q9QY14 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Foxe3Q9QY14 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Foxe3Q9QY14 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Foxe3Q9QY14 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Foxe3Q9QY14 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Foxe3Q9QY14 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Foxe3Q9QY14 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Foxe3Q9QY14 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Foxe3Q9QY14 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Foxe3Q9QY14 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Foxe3Q9QY14 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Foxe3Q9QY14 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Foxe3Q9QY14 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Foxe3Q9QY14 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Foxe3Q9QY14 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Foxe3Q9QY14 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Foxe3Q9QY14 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Foxe3Q9QY14 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Foxe3Q9QY14 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Foxe3Q9QY14 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Foxe3Q9QY14 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Foxe3Q9QY14 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Foxe3Q9QY14 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms