Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ9

Opn4, Melanopsin, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn4Q9QXZ9 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Opn4Q9QXZ9 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Opn4Q9QXZ9 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Opn4Q9QXZ9 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Opn4Q9QXZ9 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Opn4Q9QXZ9 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Opn4Q9QXZ9 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Opn4Q9QXZ9 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Opn4Q9QXZ9 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Opn4Q9QXZ9 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Opn4Q9QXZ9 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Opn4Q9QXZ9 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Opn4Q9QXZ9 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Opn4Q9QXZ9 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Opn4Q9QXZ9 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Opn4Q9QXZ9 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Opn4Q9QXZ9 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Opn4Q9QXZ9 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Opn4Q9QXZ9 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Opn4Q9QXZ9 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Opn4Q9QXZ9 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Opn4Q9QXZ9 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Opn4Q9QXZ9 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Opn4Q9QXZ9 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Opn4Q9QXZ9 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Opn4Q9QXZ9 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Opn4Q9QXZ9 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Opn4Q9QXZ9 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Opn4Q9QXZ9 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Opn4Q9QXZ9 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Opn4Q9QXZ9 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Opn4Q9QXZ9 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Opn4Q9QXZ9 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Opn4Q9QXZ9 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Opn4Q9QXZ9 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Opn4Q9QXZ9 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Opn4Q9QXZ9 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Opn4Q9QXZ9 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Opn4Q9QXZ9 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Opn4Q9QXZ9 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Opn4Q9QXZ9 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Opn4Q9QXZ9 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Opn4Q9QXZ9 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Opn4Q9QXZ9 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Opn4Q9QXZ9 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Opn4Q9QXZ9 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Opn4Q9QXZ9 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Opn4Q9QXZ9 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Opn4Q9QXZ9 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Opn4Q9QXZ9 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Opn4Q9QXZ9 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Opn4Q9QXZ9 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Opn4Q9QXZ9 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Opn4Q9QXZ9 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Opn4Q9QXZ9 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Opn4Q9QXZ9 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Opn4Q9QXZ9 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Opn4Q9QXZ9 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Opn4Q9QXZ9 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Opn4Q9QXZ9 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Opn4Q9QXZ9 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Opn4Q9QXZ9 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Opn4Q9QXZ9 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Opn4Q9QXZ9 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Opn4Q9QXZ9 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Opn4Q9QXZ9 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Opn4Q9QXZ9 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Opn4Q9QXZ9 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Opn4Q9QXZ9 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Opn4Q9QXZ9 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Opn4Q9QXZ9 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Opn4Q9QXZ9 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Opn4Q9QXZ9 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Opn4Q9QXZ9 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Opn4Q9QXZ9 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Opn4Q9QXZ9 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Opn4Q9QXZ9 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Opn4Q9QXZ9 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Opn4Q9QXZ9 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Opn4Q9QXZ9 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Opn4Q9QXZ9 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Opn4Q9QXZ9 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Opn4Q9QXZ9 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Opn4Q9QXZ9 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Opn4Q9QXZ9 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Opn4Q9QXZ9 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Opn4Q9QXZ9 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Opn4Q9QXZ9 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Opn4Q9QXZ9 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Opn4Q9QXZ9 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Opn4Q9QXZ9 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Opn4Q9QXZ9 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Opn4Q9QXZ9 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Opn4Q9QXZ9 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Opn4Q9QXZ9 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Opn4Q9QXZ9 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Opn4Q9QXZ9 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Opn4Q9QXZ9 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Opn4Q9QXZ9 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Opn4Q9QXZ9 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms