Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV1

Cbx8, Chromobox protein homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx8Q9QXV1 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cbx8Q9QXV1 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Cbx8Q9QXV1 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cbx8Q9QXV1 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cbx8Q9QXV1 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cbx8Q9QXV1 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cbx8Q9QXV1 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cbx8Q9QXV1 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cbx8Q9QXV1 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cbx8Q9QXV1 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cbx8Q9QXV1 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cbx8Q9QXV1 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cbx8Q9QXV1 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cbx8Q9QXV1 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cbx8Q9QXV1 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cbx8Q9QXV1 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cbx8Q9QXV1 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cbx8Q9QXV1 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cbx8Q9QXV1 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Cbx8Q9QXV1 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cbx8Q9QXV1 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cbx8Q9QXV1 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cbx8Q9QXV1 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cbx8Q9QXV1 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cbx8Q9QXV1 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cbx8Q9QXV1 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cbx8Q9QXV1 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cbx8Q9QXV1 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cbx8Q9QXV1 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cbx8Q9QXV1 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cbx8Q9QXV1 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cbx8Q9QXV1 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cbx8Q9QXV1 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cbx8Q9QXV1 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cbx8Q9QXV1 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cbx8Q9QXV1 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cbx8Q9QXV1 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cbx8Q9QXV1 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cbx8Q9QXV1 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cbx8Q9QXV1 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cbx8Q9QXV1 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cbx8Q9QXV1 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cbx8Q9QXV1 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cbx8Q9QXV1 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cbx8Q9QXV1 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cbx8Q9QXV1 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cbx8Q9QXV1 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cbx8Q9QXV1 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cbx8Q9QXV1 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cbx8Q9QXV1 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cbx8Q9QXV1 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cbx8Q9QXV1 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cbx8Q9QXV1 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cbx8Q9QXV1 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cbx8Q9QXV1 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cbx8Q9QXV1 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cbx8Q9QXV1 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cbx8Q9QXV1 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cbx8Q9QXV1 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cbx8Q9QXV1 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cbx8Q9QXV1 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cbx8Q9QXV1 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cbx8Q9QXV1 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cbx8Q9QXV1 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cbx8Q9QXV1 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cbx8Q9QXV1 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cbx8Q9QXV1 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Cbx8Q9QXV1 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cbx8Q9QXV1 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cbx8Q9QXV1 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cbx8Q9QXV1 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Cbx8Q9QXV1 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cbx8Q9QXV1 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Cbx8Q9QXV1 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cbx8Q9QXV1 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cbx8Q9QXV1 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cbx8Q9QXV1 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cbx8Q9QXV1 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cbx8Q9QXV1 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cbx8Q9QXV1 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cbx8Q9QXV1 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cbx8Q9QXV1 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cbx8Q9QXV1 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cbx8Q9QXV1 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cbx8Q9QXV1 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cbx8Q9QXV1 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cbx8Q9QXV1 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cbx8Q9QXV1 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cbx8Q9QXV1 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cbx8Q9QXV1 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cbx8Q9QXV1 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cbx8Q9QXV1 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cbx8Q9QXV1 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Cbx8Q9QXV1 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cbx8Q9QXV1 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cbx8Q9QXV1 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cbx8Q9QXV1 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cbx8Q9QXV1 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cbx8Q9QXV1 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cbx8Q9QXV1 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms