Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT8

Kcnip3, Calsenilin, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip3Q9QXT8 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnip3Q9QXT8 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnip3Q9QXT8 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnip3Q9QXT8 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnip3Q9QXT8 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnip3Q9QXT8 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnip3Q9QXT8 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnip3Q9QXT8 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnip3Q9QXT8 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnip3Q9QXT8 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnip3Q9QXT8 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnip3Q9QXT8 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcnip3Q9QXT8 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcnip3Q9QXT8 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcnip3Q9QXT8 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcnip3Q9QXT8 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcnip3Q9QXT8 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcnip3Q9QXT8 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcnip3Q9QXT8 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcnip3Q9QXT8 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcnip3Q9QXT8 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcnip3Q9QXT8 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcnip3Q9QXT8 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcnip3Q9QXT8 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcnip3Q9QXT8 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcnip3Q9QXT8 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcnip3Q9QXT8 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcnip3Q9QXT8 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcnip3Q9QXT8 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcnip3Q9QXT8 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcnip3Q9QXT8 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcnip3Q9QXT8 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcnip3Q9QXT8 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcnip3Q9QXT8 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcnip3Q9QXT8 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcnip3Q9QXT8 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcnip3Q9QXT8 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcnip3Q9QXT8 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcnip3Q9QXT8 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcnip3Q9QXT8 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcnip3Q9QXT8 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcnip3Q9QXT8 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcnip3Q9QXT8 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcnip3Q9QXT8 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcnip3Q9QXT8 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcnip3Q9QXT8 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcnip3Q9QXT8 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcnip3Q9QXT8 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcnip3Q9QXT8 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Kcnip3Q9QXT8 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Kcnip3Q9QXT8 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Kcnip3Q9QXT8 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Kcnip3Q9QXT8 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Kcnip3Q9QXT8 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Kcnip3Q9QXT8 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Kcnip3Q9QXT8 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Kcnip3Q9QXT8 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Kcnip3Q9QXT8 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Kcnip3Q9QXT8 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Kcnip3Q9QXT8 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Kcnip3Q9QXT8 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Kcnip3Q9QXT8 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Kcnip3Q9QXT8 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Kcnip3Q9QXT8 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Kcnip3Q9QXT8 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Kcnip3Q9QXT8 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Kcnip3Q9QXT8 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Kcnip3Q9QXT8 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Kcnip3Q9QXT8 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Kcnip3Q9QXT8 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Kcnip3Q9QXT8 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Kcnip3Q9QXT8 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Kcnip3Q9QXT8 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Kcnip3Q9QXT8 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Kcnip3Q9QXT8 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Kcnip3Q9QXT8 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Kcnip3Q9QXT8 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Kcnip3Q9QXT8 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Kcnip3Q9QXT8 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Kcnip3Q9QXT8 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Kcnip3Q9QXT8 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Kcnip3Q9QXT8 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Kcnip3Q9QXT8 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Kcnip3Q9QXT8 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Kcnip3Q9QXT8 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Kcnip3Q9QXT8 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Kcnip3Q9QXT8 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Kcnip3Q9QXT8 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Kcnip3Q9QXT8 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Kcnip3Q9QXT8 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Kcnip3Q9QXT8 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Kcnip3Q9QXT8 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Kcnip3Q9QXT8 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Kcnip3Q9QXT8 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Kcnip3Q9QXT8 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Kcnip3Q9QXT8 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Kcnip3Q9QXT8 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Kcnip3Q9QXT8 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Kcnip3Q9QXT8 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Kcnip3Q9QXT8 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms