Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK3

Copg2, Coatomer subunit gamma-2, mousemouse

Predictions only

Length 871 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copg2Q9QXK3 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Copg2Q9QXK3 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Copg2Q9QXK3 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Copg2Q9QXK3 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Copg2Q9QXK3 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Copg2Q9QXK3 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Copg2Q9QXK3 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Copg2Q9QXK3 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Copg2Q9QXK3 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Copg2Q9QXK3 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Copg2Q9QXK3 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Copg2Q9QXK3 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Copg2Q9QXK3 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Copg2Q9QXK3 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Copg2Q9QXK3 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Copg2Q9QXK3 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Copg2Q9QXK3 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Copg2Q9QXK3 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Copg2Q9QXK3 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Copg2Q9QXK3 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Copg2Q9QXK3 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Copg2Q9QXK3 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Copg2Q9QXK3 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Copg2Q9QXK3 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Copg2Q9QXK3 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Copg2Q9QXK3 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Copg2Q9QXK3 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Copg2Q9QXK3 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Copg2Q9QXK3 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Copg2Q9QXK3 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Copg2Q9QXK3 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Copg2Q9QXK3 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Copg2Q9QXK3 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Copg2Q9QXK3 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Copg2Q9QXK3 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Copg2Q9QXK3 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Copg2Q9QXK3 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Copg2Q9QXK3 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Copg2Q9QXK3 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Copg2Q9QXK3 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Copg2Q9QXK3 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Copg2Q9QXK3 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Copg2Q9QXK3 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Copg2Q9QXK3 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Copg2Q9QXK3 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Copg2Q9QXK3 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Copg2Q9QXK3 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Copg2Q9QXK3 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Copg2Q9QXK3 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Copg2Q9QXK3 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Copg2Q9QXK3 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Copg2Q9QXK3 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Copg2Q9QXK3 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Copg2Q9QXK3 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Copg2Q9QXK3 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Copg2Q9QXK3 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Copg2Q9QXK3 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Copg2Q9QXK3 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Copg2Q9QXK3 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Copg2Q9QXK3 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Copg2Q9QXK3 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Copg2Q9QXK3 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Copg2Q9QXK3 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Copg2Q9QXK3 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Copg2Q9QXK3 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Copg2Q9QXK3 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Copg2Q9QXK3 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Copg2Q9QXK3 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Copg2Q9QXK3 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Copg2Q9QXK3 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Copg2Q9QXK3 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Copg2Q9QXK3 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Copg2Q9QXK3 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Copg2Q9QXK3 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Copg2Q9QXK3 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Copg2Q9QXK3 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Copg2Q9QXK3 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Copg2Q9QXK3 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Copg2Q9QXK3 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Copg2Q9QXK3 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Copg2Q9QXK3 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Copg2Q9QXK3 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Copg2Q9QXK3 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Copg2Q9QXK3 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Copg2Q9QXK3 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Copg2Q9QXK3 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Copg2Q9QXK3 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Copg2Q9QXK3 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Copg2Q9QXK3 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Copg2Q9QXK3 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Copg2Q9QXK3 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Copg2Q9QXK3 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Copg2Q9QXK3 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Copg2Q9QXK3 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Copg2Q9QXK3 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Copg2Q9QXK3 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Copg2Q9QXK3 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Copg2Q9QXK3 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Copg2Q9QXK3 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Copg2Q9QXK3 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms