Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA5

Lsm4, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm4Q9QXA5 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lsm4Q9QXA5 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lsm4Q9QXA5 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lsm4Q9QXA5 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lsm4Q9QXA5 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lsm4Q9QXA5 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lsm4Q9QXA5 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lsm4Q9QXA5 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lsm4Q9QXA5 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lsm4Q9QXA5 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lsm4Q9QXA5 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lsm4Q9QXA5 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lsm4Q9QXA5 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lsm4Q9QXA5 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lsm4Q9QXA5 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lsm4Q9QXA5 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lsm4Q9QXA5 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lsm4Q9QXA5 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lsm4Q9QXA5 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lsm4Q9QXA5 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lsm4Q9QXA5 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lsm4Q9QXA5 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lsm4Q9QXA5 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lsm4Q9QXA5 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lsm4Q9QXA5 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lsm4Q9QXA5 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lsm4Q9QXA5 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lsm4Q9QXA5 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lsm4Q9QXA5 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lsm4Q9QXA5 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lsm4Q9QXA5 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lsm4Q9QXA5 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lsm4Q9QXA5 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lsm4Q9QXA5 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lsm4Q9QXA5 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lsm4Q9QXA5 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lsm4Q9QXA5 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lsm4Q9QXA5 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lsm4Q9QXA5 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lsm4Q9QXA5 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lsm4Q9QXA5 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lsm4Q9QXA5 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lsm4Q9QXA5 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lsm4Q9QXA5 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lsm4Q9QXA5 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lsm4Q9QXA5 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lsm4Q9QXA5 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lsm4Q9QXA5 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lsm4Q9QXA5 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lsm4Q9QXA5 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lsm4Q9QXA5 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lsm4Q9QXA5 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lsm4Q9QXA5 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Lsm4Q9QXA5 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lsm4Q9QXA5 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Lsm4Q9QXA5 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Lsm4Q9QXA5 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lsm4Q9QXA5 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lsm4Q9QXA5 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lsm4Q9QXA5 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lsm4Q9QXA5 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lsm4Q9QXA5 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lsm4Q9QXA5 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lsm4Q9QXA5 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lsm4Q9QXA5 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lsm4Q9QXA5 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lsm4Q9QXA5 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lsm4Q9QXA5 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lsm4Q9QXA5 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lsm4Q9QXA5 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lsm4Q9QXA5 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lsm4Q9QXA5 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lsm4Q9QXA5 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lsm4Q9QXA5 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lsm4Q9QXA5 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lsm4Q9QXA5 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lsm4Q9QXA5 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lsm4Q9QXA5 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lsm4Q9QXA5 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lsm4Q9QXA5 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lsm4Q9QXA5 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lsm4Q9QXA5 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lsm4Q9QXA5 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lsm4Q9QXA5 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Lsm4Q9QXA5 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lsm4Q9QXA5 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lsm4Q9QXA5 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Lsm4Q9QXA5 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Lsm4Q9QXA5 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lsm4Q9QXA5 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lsm4Q9QXA5 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lsm4Q9QXA5 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lsm4Q9QXA5 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lsm4Q9QXA5 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lsm4Q9QXA5 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lsm4Q9QXA5 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lsm4Q9QXA5 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lsm4Q9QXA5 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lsm4Q9QXA5 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lsm4Q9QXA5 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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