Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA1

Cyhr1, Cysteine and histidine-rich protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyhr1Q9QXA1 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cyhr1Q9QXA1 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cyhr1Q9QXA1 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cyhr1Q9QXA1 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cyhr1Q9QXA1 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cyhr1Q9QXA1 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cyhr1Q9QXA1 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cyhr1Q9QXA1 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cyhr1Q9QXA1 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cyhr1Q9QXA1 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cyhr1Q9QXA1 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cyhr1Q9QXA1 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cyhr1Q9QXA1 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cyhr1Q9QXA1 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cyhr1Q9QXA1 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cyhr1Q9QXA1 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cyhr1Q9QXA1 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cyhr1Q9QXA1 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cyhr1Q9QXA1 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cyhr1Q9QXA1 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cyhr1Q9QXA1 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cyhr1Q9QXA1 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cyhr1Q9QXA1 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cyhr1Q9QXA1 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cyhr1Q9QXA1 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cyhr1Q9QXA1 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cyhr1Q9QXA1 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cyhr1Q9QXA1 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cyhr1Q9QXA1 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cyhr1Q9QXA1 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cyhr1Q9QXA1 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cyhr1Q9QXA1 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cyhr1Q9QXA1 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cyhr1Q9QXA1 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cyhr1Q9QXA1 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cyhr1Q9QXA1 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cyhr1Q9QXA1 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cyhr1Q9QXA1 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cyhr1Q9QXA1 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cyhr1Q9QXA1 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cyhr1Q9QXA1 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cyhr1Q9QXA1 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cyhr1Q9QXA1 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cyhr1Q9QXA1 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cyhr1Q9QXA1 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cyhr1Q9QXA1 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cyhr1Q9QXA1 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cyhr1Q9QXA1 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cyhr1Q9QXA1 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cyhr1Q9QXA1 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cyhr1Q9QXA1 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cyhr1Q9QXA1 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cyhr1Q9QXA1 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cyhr1Q9QXA1 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cyhr1Q9QXA1 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cyhr1Q9QXA1 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cyhr1Q9QXA1 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cyhr1Q9QXA1 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cyhr1Q9QXA1 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cyhr1Q9QXA1 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cyhr1Q9QXA1 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cyhr1Q9QXA1 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cyhr1Q9QXA1 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cyhr1Q9QXA1 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cyhr1Q9QXA1 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cyhr1Q9QXA1 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cyhr1Q9QXA1 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cyhr1Q9QXA1 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cyhr1Q9QXA1 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cyhr1Q9QXA1 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cyhr1Q9QXA1 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cyhr1Q9QXA1 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cyhr1Q9QXA1 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cyhr1Q9QXA1 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cyhr1Q9QXA1 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cyhr1Q9QXA1 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cyhr1Q9QXA1 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cyhr1Q9QXA1 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cyhr1Q9QXA1 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cyhr1Q9QXA1 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cyhr1Q9QXA1 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cyhr1Q9QXA1 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cyhr1Q9QXA1 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cyhr1Q9QXA1 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cyhr1Q9QXA1 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cyhr1Q9QXA1 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cyhr1Q9QXA1 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cyhr1Q9QXA1 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cyhr1Q9QXA1 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cyhr1Q9QXA1 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cyhr1Q9QXA1 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cyhr1Q9QXA1 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cyhr1Q9QXA1 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cyhr1Q9QXA1 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cyhr1Q9QXA1 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cyhr1Q9QXA1 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cyhr1Q9QXA1 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cyhr1Q9QXA1 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cyhr1Q9QXA1 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cyhr1Q9QXA1 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms