Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWZ1

Rad1, Cell cycle checkpoint protein RAD1, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad1Q9QWZ1 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rad1Q9QWZ1 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rad1Q9QWZ1 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rad1Q9QWZ1 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rad1Q9QWZ1 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rad1Q9QWZ1 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rad1Q9QWZ1 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rad1Q9QWZ1 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rad1Q9QWZ1 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rad1Q9QWZ1 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rad1Q9QWZ1 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rad1Q9QWZ1 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rad1Q9QWZ1 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rad1Q9QWZ1 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rad1Q9QWZ1 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rad1Q9QWZ1 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rad1Q9QWZ1 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rad1Q9QWZ1 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rad1Q9QWZ1 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rad1Q9QWZ1 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rad1Q9QWZ1 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rad1Q9QWZ1 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rad1Q9QWZ1 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rad1Q9QWZ1 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rad1Q9QWZ1 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rad1Q9QWZ1 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rad1Q9QWZ1 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rad1Q9QWZ1 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rad1Q9QWZ1 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rad1Q9QWZ1 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rad1Q9QWZ1 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rad1Q9QWZ1 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rad1Q9QWZ1 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rad1Q9QWZ1 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rad1Q9QWZ1 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rad1Q9QWZ1 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rad1Q9QWZ1 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rad1Q9QWZ1 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rad1Q9QWZ1 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rad1Q9QWZ1 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rad1Q9QWZ1 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rad1Q9QWZ1 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rad1Q9QWZ1 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rad1Q9QWZ1 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rad1Q9QWZ1 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Rad1Q9QWZ1 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Rad1Q9QWZ1 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rad1Q9QWZ1 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rad1Q9QWZ1 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rad1Q9QWZ1 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rad1Q9QWZ1 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rad1Q9QWZ1 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rad1Q9QWZ1 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rad1Q9QWZ1 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rad1Q9QWZ1 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rad1Q9QWZ1 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rad1Q9QWZ1 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rad1Q9QWZ1 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rad1Q9QWZ1 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rad1Q9QWZ1 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rad1Q9QWZ1 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rad1Q9QWZ1 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rad1Q9QWZ1 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rad1Q9QWZ1 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rad1Q9QWZ1 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rad1Q9QWZ1 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rad1Q9QWZ1 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rad1Q9QWZ1 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rad1Q9QWZ1 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rad1Q9QWZ1 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rad1Q9QWZ1 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rad1Q9QWZ1 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rad1Q9QWZ1 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rad1Q9QWZ1 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rad1Q9QWZ1 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rad1Q9QWZ1 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rad1Q9QWZ1 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rad1Q9QWZ1 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rad1Q9QWZ1 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rad1Q9QWZ1 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rad1Q9QWZ1 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rad1Q9QWZ1 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rad1Q9QWZ1 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rad1Q9QWZ1 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rad1Q9QWZ1 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rad1Q9QWZ1 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rad1Q9QWZ1 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rad1Q9QWZ1 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rad1Q9QWZ1 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rad1Q9QWZ1 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rad1Q9QWZ1 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rad1Q9QWZ1 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rad1Q9QWZ1 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rad1Q9QWZ1 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rad1Q9QWZ1 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rad1Q9QWZ1 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rad1Q9QWZ1 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rad1Q9QWZ1 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rad1Q9QWZ1 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rad1Q9QWZ1 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms