Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWW1

Homer2, Homer protein homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer2Q9QWW1 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Homer2Q9QWW1 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Homer2Q9QWW1 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Homer2Q9QWW1 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Homer2Q9QWW1 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Homer2Q9QWW1 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Homer2Q9QWW1 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Homer2Q9QWW1 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Homer2Q9QWW1 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Homer2Q9QWW1 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Homer2Q9QWW1 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Homer2Q9QWW1 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Homer2Q9QWW1 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Homer2Q9QWW1 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Homer2Q9QWW1 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Homer2Q9QWW1 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Homer2Q9QWW1 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Homer2Q9QWW1 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Homer2Q9QWW1 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Homer2Q9QWW1 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Homer2Q9QWW1 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Homer2Q9QWW1 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Homer2Q9QWW1 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Homer2Q9QWW1 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Homer2Q9QWW1 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Homer2Q9QWW1 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Homer2Q9QWW1 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Homer2Q9QWW1 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Homer2Q9QWW1 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Homer2Q9QWW1 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Homer2Q9QWW1 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Homer2Q9QWW1 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Homer2Q9QWW1 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Homer2Q9QWW1 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Homer2Q9QWW1 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Homer2Q9QWW1 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Homer2Q9QWW1 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Homer2Q9QWW1 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Homer2Q9QWW1 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Homer2Q9QWW1 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Homer2Q9QWW1 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Homer2Q9QWW1 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Homer2Q9QWW1 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Homer2Q9QWW1 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Homer2Q9QWW1 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Homer2Q9QWW1 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Homer2Q9QWW1 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Homer2Q9QWW1 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Homer2Q9QWW1 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Homer2Q9QWW1 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Homer2Q9QWW1 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Homer2Q9QWW1 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Homer2Q9QWW1 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Homer2Q9QWW1 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Homer2Q9QWW1 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Homer2Q9QWW1 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Homer2Q9QWW1 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Homer2Q9QWW1 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Homer2Q9QWW1 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Homer2Q9QWW1 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Homer2Q9QWW1 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Homer2Q9QWW1 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Homer2Q9QWW1 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Homer2Q9QWW1 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Homer2Q9QWW1 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Homer2Q9QWW1 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Homer2Q9QWW1 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Homer2Q9QWW1 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Homer2Q9QWW1 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Homer2Q9QWW1 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Homer2Q9QWW1 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Homer2Q9QWW1 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Homer2Q9QWW1 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Homer2Q9QWW1 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Homer2Q9QWW1 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Homer2Q9QWW1 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Homer2Q9QWW1 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Homer2Q9QWW1 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Homer2Q9QWW1 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Homer2Q9QWW1 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Homer2Q9QWW1 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Homer2Q9QWW1 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Homer2Q9QWW1 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Homer2Q9QWW1 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Homer2Q9QWW1 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Homer2Q9QWW1 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Homer2Q9QWW1 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Homer2Q9QWW1 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Homer2Q9QWW1 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Homer2Q9QWW1 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Homer2Q9QWW1 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Homer2Q9QWW1 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Homer2Q9QWW1 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Homer2Q9QWW1 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Homer2Q9QWW1 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Homer2Q9QWW1 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Homer2Q9QWW1 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Homer2Q9QWW1 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Homer2Q9QWW1 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Homer2Q9QWW1 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms