Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME7

Trappc2l, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2lQ9JME7 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc2lQ9JME7 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc2lQ9JME7 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc2lQ9JME7 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc2lQ9JME7 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc2lQ9JME7 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc2lQ9JME7 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc2lQ9JME7 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc2lQ9JME7 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc2lQ9JME7 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc2lQ9JME7 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc2lQ9JME7 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc2lQ9JME7 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc2lQ9JME7 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc2lQ9JME7 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc2lQ9JME7 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc2lQ9JME7 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc2lQ9JME7 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc2lQ9JME7 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc2lQ9JME7 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc2lQ9JME7 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc2lQ9JME7 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc2lQ9JME7 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc2lQ9JME7 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc2lQ9JME7 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc2lQ9JME7 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc2lQ9JME7 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc2lQ9JME7 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc2lQ9JME7 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc2lQ9JME7 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc2lQ9JME7 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc2lQ9JME7 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc2lQ9JME7 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc2lQ9JME7 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc2lQ9JME7 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc2lQ9JME7 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc2lQ9JME7 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc2lQ9JME7 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc2lQ9JME7 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc2lQ9JME7 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc2lQ9JME7 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc2lQ9JME7 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc2lQ9JME7 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc2lQ9JME7 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc2lQ9JME7 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc2lQ9JME7 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc2lQ9JME7 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc2lQ9JME7 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc2lQ9JME7 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc2lQ9JME7 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc2lQ9JME7 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc2lQ9JME7 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc2lQ9JME7 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc2lQ9JME7 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc2lQ9JME7 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc2lQ9JME7 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc2lQ9JME7 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc2lQ9JME7 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc2lQ9JME7 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc2lQ9JME7 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc2lQ9JME7 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc2lQ9JME7 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc2lQ9JME7 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc2lQ9JME7 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc2lQ9JME7 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc2lQ9JME7 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc2lQ9JME7 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc2lQ9JME7 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc2lQ9JME7 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc2lQ9JME7 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc2lQ9JME7 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc2lQ9JME7 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc2lQ9JME7 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc2lQ9JME7 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc2lQ9JME7 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc2lQ9JME7 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc2lQ9JME7 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc2lQ9JME7 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc2lQ9JME7 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc2lQ9JME7 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc2lQ9JME7 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc2lQ9JME7 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc2lQ9JME7 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc2lQ9JME7 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc2lQ9JME7 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc2lQ9JME7 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc2lQ9JME7 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc2lQ9JME7 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc2lQ9JME7 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc2lQ9JME7 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc2lQ9JME7 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc2lQ9JME7 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc2lQ9JME7 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc2lQ9JME7 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc2lQ9JME7 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc2lQ9JME7 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc2lQ9JME7 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc2lQ9JME7 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc2lQ9JME7 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc2lQ9JME7 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms