Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM99

Prg4, Proteoglycan 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prg4Q9JM99 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prg4Q9JM99 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prg4Q9JM99 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prg4Q9JM99 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prg4Q9JM99 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prg4Q9JM99 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prg4Q9JM99 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prg4Q9JM99 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prg4Q9JM99 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prg4Q9JM99 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Prg4Q9JM99 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prg4Q9JM99 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prg4Q9JM99 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prg4Q9JM99 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prg4Q9JM99 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prg4Q9JM99 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prg4Q9JM99 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prg4Q9JM99 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prg4Q9JM99 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prg4Q9JM99 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Prg4Q9JM99 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prg4Q9JM99 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prg4Q9JM99 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prg4Q9JM99 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prg4Q9JM99 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prg4Q9JM99 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prg4Q9JM99 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prg4Q9JM99 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prg4Q9JM99 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prg4Q9JM99 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Prg4Q9JM99 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prg4Q9JM99 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prg4Q9JM99 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prg4Q9JM99 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prg4Q9JM99 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prg4Q9JM99 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prg4Q9JM99 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prg4Q9JM99 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prg4Q9JM99 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prg4Q9JM99 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prg4Q9JM99 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prg4Q9JM99 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prg4Q9JM99 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prg4Q9JM99 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prg4Q9JM99 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prg4Q9JM99 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prg4Q9JM99 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prg4Q9JM99 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prg4Q9JM99 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prg4Q9JM99 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Prg4Q9JM99 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prg4Q9JM99 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prg4Q9JM99 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prg4Q9JM99 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prg4Q9JM99 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prg4Q9JM99 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prg4Q9JM99 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prg4Q9JM99 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prg4Q9JM99 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prg4Q9JM99 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prg4Q9JM99 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prg4Q9JM99 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Prg4Q9JM99 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prg4Q9JM99 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prg4Q9JM99 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prg4Q9JM99 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prg4Q9JM99 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prg4Q9JM99 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prg4Q9JM99 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prg4Q9JM99 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prg4Q9JM99 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prg4Q9JM99 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prg4Q9JM99 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prg4Q9JM99 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prg4Q9JM99 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prg4Q9JM99 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prg4Q9JM99 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prg4Q9JM99 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prg4Q9JM99 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prg4Q9JM99 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prg4Q9JM99 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prg4Q9JM99 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prg4Q9JM99 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prg4Q9JM99 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prg4Q9JM99 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prg4Q9JM99 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prg4Q9JM99 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prg4Q9JM99 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prg4Q9JM99 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prg4Q9JM99 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prg4Q9JM99 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prg4Q9JM99 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prg4Q9JM99 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prg4Q9JM99 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Prg4Q9JM99 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prg4Q9JM99 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prg4Q9JM99 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prg4Q9JM99 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prg4Q9JM99 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prg4Q9JM99 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms