Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Col5a3Q9JLI2 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Col5a3Q9JLI2 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Col5a3Q9JLI2 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Col5a3Q9JLI2 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Col5a3Q9JLI2 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Col5a3Q9JLI2 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Col5a3Q9JLI2 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Col5a3Q9JLI2 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Col5a3Q9JLI2 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Col5a3Q9JLI2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Col5a3Q9JLI2 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Col5a3Q9JLI2 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Col5a3Q9JLI2 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col5a3Q9JLI2 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col5a3Q9JLI2 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col5a3Q9JLI2 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col5a3Q9JLI2 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Col5a3Q9JLI2 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col5a3Q9JLI2 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col5a3Q9JLI2 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col5a3Q9JLI2 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col5a3Q9JLI2 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col5a3Q9JLI2 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col5a3Q9JLI2 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col5a3Q9JLI2 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col5a3Q9JLI2 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col5a3Q9JLI2 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col5a3Q9JLI2 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col5a3Q9JLI2 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col5a3Q9JLI2 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col5a3Q9JLI2 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col5a3Q9JLI2 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col5a3Q9JLI2 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col5a3Q9JLI2 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col5a3Q9JLI2 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col5a3Q9JLI2 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col5a3Q9JLI2 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Col5a3Q9JLI2 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col5a3Q9JLI2 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col5a3Q9JLI2 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col5a3Q9JLI2 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col5a3Q9JLI2 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col5a3Q9JLI2 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col5a3Q9JLI2 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col5a3Q9JLI2 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col5a3Q9JLI2 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col5a3Q9JLI2 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col5a3Q9JLI2 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col5a3Q9JLI2 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col5a3Q9JLI2 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col5a3Q9JLI2 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Col5a3Q9JLI2 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col5a3Q9JLI2 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col5a3Q9JLI2 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col5a3Q9JLI2 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Col5a3Q9JLI2 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Col5a3Q9JLI2 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Col5a3Q9JLI2 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Col5a3Q9JLI2 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Col5a3Q9JLI2 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Col5a3Q9JLI2 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Col5a3Q9JLI2 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Col5a3Q9JLI2 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Col5a3Q9JLI2 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Col5a3Q9JLI2 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Col5a3Q9JLI2 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Col5a3Q9JLI2 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Col5a3Q9JLI2 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Col5a3Q9JLI2 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Col5a3Q9JLI2 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Col5a3Q9JLI2 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Col5a3Q9JLI2 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Col5a3Q9JLI2 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Col5a3Q9JLI2 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Col5a3Q9JLI2 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Col5a3Q9JLI2 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Col5a3Q9JLI2 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Col5a3Q9JLI2 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Col5a3Q9JLI2 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Col5a3Q9JLI2 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Col5a3Q9JLI2 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Col5a3Q9JLI2 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Col5a3Q9JLI2 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Col5a3Q9JLI2 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Col5a3Q9JLI2 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Col5a3Q9JLI2 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Col5a3Q9JLI2 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Col5a3Q9JLI2 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Col5a3Q9JLI2 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Col5a3Q9JLI2 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Col5a3Q9JLI2 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Col5a3Q9JLI2 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Col5a3Q9JLI2 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Col5a3Q9JLI2 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Col5a3Q9JLI2 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Col5a3Q9JLI2 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Col5a3Q9JLI2 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Col5a3Q9JLI2 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Col5a3Q9JLI2 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms