Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLH8

Tmod4, Tropomodulin-4, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod4Q9JLH8 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Tmod4Q9JLH8 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Tmod4Q9JLH8 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tmod4Q9JLH8 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tmod4Q9JLH8 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tmod4Q9JLH8 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tmod4Q9JLH8 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tmod4Q9JLH8 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
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Tmod4Q9JLH8 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tmod4Q9JLH8 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Tmod4Q9JLH8 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tmod4Q9JLH8 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tmod4Q9JLH8 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tmod4Q9JLH8 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tmod4Q9JLH8 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tmod4Q9JLH8 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tmod4Q9JLH8 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tmod4Q9JLH8 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tmod4Q9JLH8 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmod4Q9JLH8 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmod4Q9JLH8 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmod4Q9JLH8 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmod4Q9JLH8 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmod4Q9JLH8 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmod4Q9JLH8 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmod4Q9JLH8 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmod4Q9JLH8 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmod4Q9JLH8 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmod4Q9JLH8 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
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Tmod4Q9JLH8 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmod4Q9JLH8 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmod4Q9JLH8 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmod4Q9JLH8 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmod4Q9JLH8 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmod4Q9JLH8 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmod4Q9JLH8 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmod4Q9JLH8 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmod4Q9JLH8 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmod4Q9JLH8 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmod4Q9JLH8 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmod4Q9JLH8 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
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Tmod4Q9JLH8 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tmod4Q9JLH8 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tmod4Q9JLH8 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
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Tmod4Q9JLH8 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tmod4Q9JLH8 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Tmod4Q9JLH8 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tmod4Q9JLH8 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tmod4Q9JLH8 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tmod4Q9JLH8 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
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Tmod4Q9JLH8 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tmod4Q9JLH8 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tmod4Q9JLH8 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tmod4Q9JLH8 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tmod4Q9JLH8 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tmod4Q9JLH8 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
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Tmod4Q9JLH8 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tmod4Q9JLH8 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
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Tmod4Q9JLH8 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tmod4Q9JLH8 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Tmod4Q9JLH8 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tmod4Q9JLH8 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
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Tmod4Q9JLH8 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tmod4Q9JLH8 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tmod4Q9JLH8 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tmod4Q9JLH8 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
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Tmod4Q9JLH8 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tmod4Q9JLH8 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tmod4Q9JLH8 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tmod4Q9JLH8 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tmod4Q9JLH8 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tmod4Q9JLH8 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tmod4Q9JLH8 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tmod4Q9JLH8 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tmod4Q9JLH8 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tmod4Q9JLH8 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tmod4Q9JLH8 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tmod4Q9JLH8 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tmod4Q9JLH8 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tmod4Q9JLH8 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tmod4Q9JLH8 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tmod4Q9JLH8 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tmod4Q9JLH8 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tmod4Q9JLH8 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms