Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF6

Tgm1, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase K, mousemouse

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm1Q9JLF6 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Tgm1Q9JLF6 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Tgm1Q9JLF6 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Tgm1Q9JLF6 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tgm1Q9JLF6 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tgm1Q9JLF6 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tgm1Q9JLF6 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tgm1Q9JLF6 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tgm1Q9JLF6 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tgm1Q9JLF6 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tgm1Q9JLF6 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tgm1Q9JLF6 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tgm1Q9JLF6 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tgm1Q9JLF6 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tgm1Q9JLF6 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tgm1Q9JLF6 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tgm1Q9JLF6 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tgm1Q9JLF6 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tgm1Q9JLF6 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tgm1Q9JLF6 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tgm1Q9JLF6 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tgm1Q9JLF6 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tgm1Q9JLF6 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tgm1Q9JLF6 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tgm1Q9JLF6 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tgm1Q9JLF6 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tgm1Q9JLF6 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Tgm1Q9JLF6 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tgm1Q9JLF6 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tgm1Q9JLF6 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tgm1Q9JLF6 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tgm1Q9JLF6 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tgm1Q9JLF6 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tgm1Q9JLF6 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tgm1Q9JLF6 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tgm1Q9JLF6 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tgm1Q9JLF6 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tgm1Q9JLF6 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tgm1Q9JLF6 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tgm1Q9JLF6 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tgm1Q9JLF6 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tgm1Q9JLF6 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tgm1Q9JLF6 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tgm1Q9JLF6 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tgm1Q9JLF6 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tgm1Q9JLF6 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tgm1Q9JLF6 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tgm1Q9JLF6 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tgm1Q9JLF6 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tgm1Q9JLF6 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Tgm1Q9JLF6 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tgm1Q9JLF6 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tgm1Q9JLF6 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tgm1Q9JLF6 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tgm1Q9JLF6 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tgm1Q9JLF6 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tgm1Q9JLF6 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tgm1Q9JLF6 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tgm1Q9JLF6 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tgm1Q9JLF6 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tgm1Q9JLF6 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tgm1Q9JLF6 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tgm1Q9JLF6 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tgm1Q9JLF6 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tgm1Q9JLF6 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tgm1Q9JLF6 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tgm1Q9JLF6 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tgm1Q9JLF6 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tgm1Q9JLF6 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tgm1Q9JLF6 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tgm1Q9JLF6 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tgm1Q9JLF6 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tgm1Q9JLF6 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tgm1Q9JLF6 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tgm1Q9JLF6 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tgm1Q9JLF6 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tgm1Q9JLF6 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tgm1Q9JLF6 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tgm1Q9JLF6 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tgm1Q9JLF6 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Tgm1Q9JLF6 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tgm1Q9JLF6 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tgm1Q9JLF6 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Tgm1Q9JLF6 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tgm1Q9JLF6 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tgm1Q9JLF6 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Tgm1Q9JLF6 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tgm1Q9JLF6 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tgm1Q9JLF6 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tgm1Q9JLF6 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tgm1Q9JLF6 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tgm1Q9JLF6 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tgm1Q9JLF6 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tgm1Q9JLF6 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tgm1Q9JLF6 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tgm1Q9JLF6 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tgm1Q9JLF6 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tgm1Q9JLF6 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tgm1Q9JLF6 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tgm1Q9JLF6 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms