Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLC6

Tef, Thyrotroph embryonic factor, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TefQ9JLC6 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TefQ9JLC6 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TefQ9JLC6 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TefQ9JLC6 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TefQ9JLC6 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TefQ9JLC6 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TefQ9JLC6 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TefQ9JLC6 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TefQ9JLC6 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TefQ9JLC6 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
TefQ9JLC6 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TefQ9JLC6 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TefQ9JLC6 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TefQ9JLC6 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TefQ9JLC6 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TefQ9JLC6 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TefQ9JLC6 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TefQ9JLC6 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TefQ9JLC6 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TefQ9JLC6 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TefQ9JLC6 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TefQ9JLC6 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TefQ9JLC6 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TefQ9JLC6 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TefQ9JLC6 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TefQ9JLC6 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TefQ9JLC6 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TefQ9JLC6 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TefQ9JLC6 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TefQ9JLC6 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TefQ9JLC6 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TefQ9JLC6 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TefQ9JLC6 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TefQ9JLC6 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TefQ9JLC6 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
TefQ9JLC6 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
TefQ9JLC6 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TefQ9JLC6 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TefQ9JLC6 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TefQ9JLC6 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TefQ9JLC6 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TefQ9JLC6 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TefQ9JLC6 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TefQ9JLC6 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TefQ9JLC6 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TefQ9JLC6 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TefQ9JLC6 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TefQ9JLC6 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TefQ9JLC6 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TefQ9JLC6 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TefQ9JLC6 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TefQ9JLC6 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TefQ9JLC6 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TefQ9JLC6 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TefQ9JLC6 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TefQ9JLC6 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TefQ9JLC6 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TefQ9JLC6 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TefQ9JLC6 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TefQ9JLC6 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TefQ9JLC6 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TefQ9JLC6 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TefQ9JLC6 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TefQ9JLC6 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TefQ9JLC6 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TefQ9JLC6 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TefQ9JLC6 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TefQ9JLC6 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TefQ9JLC6 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TefQ9JLC6 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TefQ9JLC6 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TefQ9JLC6 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TefQ9JLC6 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TefQ9JLC6 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TefQ9JLC6 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TefQ9JLC6 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TefQ9JLC6 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TefQ9JLC6 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TefQ9JLC6 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TefQ9JLC6 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TefQ9JLC6 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TefQ9JLC6 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TefQ9JLC6 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TefQ9JLC6 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TefQ9JLC6 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TefQ9JLC6 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TefQ9JLC6 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TefQ9JLC6 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TefQ9JLC6 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TefQ9JLC6 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TefQ9JLC6 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TefQ9JLC6 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TefQ9JLC6 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TefQ9JLC6 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TefQ9JLC6 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TefQ9JLC6 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TefQ9JLC6 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TefQ9JLC6 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TefQ9JLC6 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TefQ9JLC6 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms