Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS4

Ldb3, LIM domain-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb3Q9JKS4 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ldb3Q9JKS4 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ldb3Q9JKS4 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ldb3Q9JKS4 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ldb3Q9JKS4 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ldb3Q9JKS4 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ldb3Q9JKS4 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ldb3Q9JKS4 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ldb3Q9JKS4 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ldb3Q9JKS4 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ldb3Q9JKS4 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ldb3Q9JKS4 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ldb3Q9JKS4 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ldb3Q9JKS4 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ldb3Q9JKS4 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ldb3Q9JKS4 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ldb3Q9JKS4 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ldb3Q9JKS4 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ldb3Q9JKS4 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ldb3Q9JKS4 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ldb3Q9JKS4 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ldb3Q9JKS4 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ldb3Q9JKS4 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ldb3Q9JKS4 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ldb3Q9JKS4 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ldb3Q9JKS4 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ldb3Q9JKS4 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ldb3Q9JKS4 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ldb3Q9JKS4 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ldb3Q9JKS4 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ldb3Q9JKS4 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ldb3Q9JKS4 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ldb3Q9JKS4 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ldb3Q9JKS4 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ldb3Q9JKS4 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ldb3Q9JKS4 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ldb3Q9JKS4 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ldb3Q9JKS4 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ldb3Q9JKS4 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ldb3Q9JKS4 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ldb3Q9JKS4 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ldb3Q9JKS4 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ldb3Q9JKS4 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ldb3Q9JKS4 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ldb3Q9JKS4 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ldb3Q9JKS4 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ldb3Q9JKS4 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ldb3Q9JKS4 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ldb3Q9JKS4 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ldb3Q9JKS4 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ldb3Q9JKS4 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ldb3Q9JKS4 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ldb3Q9JKS4 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ldb3Q9JKS4 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ldb3Q9JKS4 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ldb3Q9JKS4 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ldb3Q9JKS4 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ldb3Q9JKS4 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ldb3Q9JKS4 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ldb3Q9JKS4 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ldb3Q9JKS4 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ldb3Q9JKS4 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ldb3Q9JKS4 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ldb3Q9JKS4 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ldb3Q9JKS4 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ldb3Q9JKS4 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ldb3Q9JKS4 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ldb3Q9JKS4 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ldb3Q9JKS4 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ldb3Q9JKS4 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ldb3Q9JKS4 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ldb3Q9JKS4 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ldb3Q9JKS4 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ldb3Q9JKS4 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ldb3Q9JKS4 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ldb3Q9JKS4 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ldb3Q9JKS4 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ldb3Q9JKS4 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ldb3Q9JKS4 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ldb3Q9JKS4 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ldb3Q9JKS4 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ldb3Q9JKS4 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ldb3Q9JKS4 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ldb3Q9JKS4 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ldb3Q9JKS4 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ldb3Q9JKS4 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ldb3Q9JKS4 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ldb3Q9JKS4 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ldb3Q9JKS4 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ldb3Q9JKS4 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ldb3Q9JKS4 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ldb3Q9JKS4 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ldb3Q9JKS4 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ldb3Q9JKS4 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ldb3Q9JKS4 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ldb3Q9JKS4 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ldb3Q9JKS4 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ldb3Q9JKS4 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ldb3Q9JKS4 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ldb3Q9JKS4 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.4 ms