Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP8

Chrac1, Chromatin accessibility complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrac1Q9JKP8 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chrac1Q9JKP8 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chrac1Q9JKP8 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chrac1Q9JKP8 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chrac1Q9JKP8 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chrac1Q9JKP8 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chrac1Q9JKP8 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chrac1Q9JKP8 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Chrac1Q9JKP8 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chrac1Q9JKP8 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chrac1Q9JKP8 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chrac1Q9JKP8 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chrac1Q9JKP8 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chrac1Q9JKP8 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chrac1Q9JKP8 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chrac1Q9JKP8 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chrac1Q9JKP8 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chrac1Q9JKP8 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chrac1Q9JKP8 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chrac1Q9JKP8 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chrac1Q9JKP8 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chrac1Q9JKP8 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chrac1Q9JKP8 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chrac1Q9JKP8 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chrac1Q9JKP8 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chrac1Q9JKP8 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Chrac1Q9JKP8 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chrac1Q9JKP8 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Chrac1Q9JKP8 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chrac1Q9JKP8 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chrac1Q9JKP8 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chrac1Q9JKP8 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chrac1Q9JKP8 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chrac1Q9JKP8 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chrac1Q9JKP8 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chrac1Q9JKP8 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chrac1Q9JKP8 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chrac1Q9JKP8 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chrac1Q9JKP8 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chrac1Q9JKP8 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chrac1Q9JKP8 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Chrac1Q9JKP8 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Chrac1Q9JKP8 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chrac1Q9JKP8 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chrac1Q9JKP8 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chrac1Q9JKP8 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chrac1Q9JKP8 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chrac1Q9JKP8 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chrac1Q9JKP8 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chrac1Q9JKP8 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chrac1Q9JKP8 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chrac1Q9JKP8 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chrac1Q9JKP8 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chrac1Q9JKP8 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chrac1Q9JKP8 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chrac1Q9JKP8 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chrac1Q9JKP8 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chrac1Q9JKP8 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chrac1Q9JKP8 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chrac1Q9JKP8 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chrac1Q9JKP8 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chrac1Q9JKP8 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chrac1Q9JKP8 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chrac1Q9JKP8 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chrac1Q9JKP8 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chrac1Q9JKP8 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chrac1Q9JKP8 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chrac1Q9JKP8 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chrac1Q9JKP8 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chrac1Q9JKP8 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chrac1Q9JKP8 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chrac1Q9JKP8 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chrac1Q9JKP8 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chrac1Q9JKP8 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chrac1Q9JKP8 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chrac1Q9JKP8 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chrac1Q9JKP8 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chrac1Q9JKP8 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chrac1Q9JKP8 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chrac1Q9JKP8 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chrac1Q9JKP8 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chrac1Q9JKP8 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chrac1Q9JKP8 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chrac1Q9JKP8 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chrac1Q9JKP8 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chrac1Q9JKP8 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chrac1Q9JKP8 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chrac1Q9JKP8 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chrac1Q9JKP8 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chrac1Q9JKP8 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chrac1Q9JKP8 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chrac1Q9JKP8 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chrac1Q9JKP8 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chrac1Q9JKP8 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Chrac1Q9JKP8 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Chrac1Q9JKP8 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chrac1Q9JKP8 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chrac1Q9JKP8 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chrac1Q9JKP8 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chrac1Q9JKP8 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms