Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK1

Stx6, Syntaxin-6, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx6Q9JKK1 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Stx6Q9JKK1 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Stx6Q9JKK1 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Stx6Q9JKK1 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Stx6Q9JKK1 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Stx6Q9JKK1 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Stx6Q9JKK1 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Stx6Q9JKK1 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Stx6Q9JKK1 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Stx6Q9JKK1 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Stx6Q9JKK1 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Stx6Q9JKK1 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Stx6Q9JKK1 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Stx6Q9JKK1 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Stx6Q9JKK1 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Stx6Q9JKK1 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Stx6Q9JKK1 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Stx6Q9JKK1 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Stx6Q9JKK1 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Stx6Q9JKK1 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Stx6Q9JKK1 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Stx6Q9JKK1 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Stx6Q9JKK1 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Stx6Q9JKK1 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Stx6Q9JKK1 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Stx6Q9JKK1 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Stx6Q9JKK1 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Stx6Q9JKK1 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Stx6Q9JKK1 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Stx6Q9JKK1 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Stx6Q9JKK1 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Stx6Q9JKK1 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Stx6Q9JKK1 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Stx6Q9JKK1 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Stx6Q9JKK1 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Stx6Q9JKK1 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Stx6Q9JKK1 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Stx6Q9JKK1 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Stx6Q9JKK1 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Stx6Q9JKK1 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Stx6Q9JKK1 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Stx6Q9JKK1 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Stx6Q9JKK1 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Stx6Q9JKK1 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Stx6Q9JKK1 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Stx6Q9JKK1 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Stx6Q9JKK1 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Stx6Q9JKK1 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Stx6Q9JKK1 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Stx6Q9JKK1 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Stx6Q9JKK1 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Stx6Q9JKK1 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Stx6Q9JKK1 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Stx6Q9JKK1 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Stx6Q9JKK1 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Stx6Q9JKK1 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Stx6Q9JKK1 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Stx6Q9JKK1 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Stx6Q9JKK1 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Stx6Q9JKK1 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Stx6Q9JKK1 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Stx6Q9JKK1 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Stx6Q9JKK1 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Stx6Q9JKK1 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Stx6Q9JKK1 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Stx6Q9JKK1 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Stx6Q9JKK1 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Stx6Q9JKK1 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Stx6Q9JKK1 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Stx6Q9JKK1 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Stx6Q9JKK1 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Stx6Q9JKK1 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Stx6Q9JKK1 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Stx6Q9JKK1 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Stx6Q9JKK1 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Stx6Q9JKK1 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Stx6Q9JKK1 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Stx6Q9JKK1 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Stx6Q9JKK1 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Stx6Q9JKK1 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Stx6Q9JKK1 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Stx6Q9JKK1 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Stx6Q9JKK1 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Stx6Q9JKK1 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Stx6Q9JKK1 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Stx6Q9JKK1 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Stx6Q9JKK1 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Stx6Q9JKK1 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Stx6Q9JKK1 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Stx6Q9JKK1 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Stx6Q9JKK1 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Stx6Q9JKK1 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Stx6Q9JKK1 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Stx6Q9JKK1 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Stx6Q9JKK1 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Stx6Q9JKK1 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Stx6Q9JKK1 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Stx6Q9JKK1 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Stx6Q9JKK1 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Stx6Q9JKK1 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms