Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Scamp5Q9JKD3 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Scamp5Q9JKD3 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Scamp5Q9JKD3 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Scamp5Q9JKD3 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Scamp5Q9JKD3 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Scamp5Q9JKD3 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Scamp5Q9JKD3 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Scamp5Q9JKD3 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Scamp5Q9JKD3 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Scamp5Q9JKD3 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Scamp5Q9JKD3 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Scamp5Q9JKD3 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Scamp5Q9JKD3 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Scamp5Q9JKD3 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Scamp5Q9JKD3 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Scamp5Q9JKD3 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Scamp5Q9JKD3 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Scamp5Q9JKD3 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Scamp5Q9JKD3 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Scamp5Q9JKD3 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Scamp5Q9JKD3 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Scamp5Q9JKD3 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Scamp5Q9JKD3 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Scamp5Q9JKD3 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Scamp5Q9JKD3 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Scamp5Q9JKD3 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Scamp5Q9JKD3 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Scamp5Q9JKD3 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Scamp5Q9JKD3 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Scamp5Q9JKD3 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Scamp5Q9JKD3 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Scamp5Q9JKD3 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Scamp5Q9JKD3 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Scamp5Q9JKD3 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Scamp5Q9JKD3 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Scamp5Q9JKD3 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Scamp5Q9JKD3 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Scamp5Q9JKD3 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Scamp5Q9JKD3 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Scamp5Q9JKD3 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Scamp5Q9JKD3 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Scamp5Q9JKD3 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Scamp5Q9JKD3 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Scamp5Q9JKD3 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Scamp5Q9JKD3 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Scamp5Q9JKD3 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Scamp5Q9JKD3 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Scamp5Q9JKD3 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Scamp5Q9JKD3 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Scamp5Q9JKD3 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Scamp5Q9JKD3 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Scamp5Q9JKD3 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Scamp5Q9JKD3 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Scamp5Q9JKD3 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Scamp5Q9JKD3 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Scamp5Q9JKD3 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Scamp5Q9JKD3 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Scamp5Q9JKD3 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Scamp5Q9JKD3 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Scamp5Q9JKD3 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Scamp5Q9JKD3 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Scamp5Q9JKD3 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Scamp5Q9JKD3 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Scamp5Q9JKD3 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Scamp5Q9JKD3 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Scamp5Q9JKD3 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Scamp5Q9JKD3 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Scamp5Q9JKD3 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Scamp5Q9JKD3 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Scamp5Q9JKD3 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Scamp5Q9JKD3 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Scamp5Q9JKD3 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Scamp5Q9JKD3 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Scamp5Q9JKD3 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Scamp5Q9JKD3 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Scamp5Q9JKD3 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Scamp5Q9JKD3 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Scamp5Q9JKD3 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Scamp5Q9JKD3 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Scamp5Q9JKD3 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Scamp5Q9JKD3 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Scamp5Q9JKD3 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Scamp5Q9JKD3 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Scamp5Q9JKD3 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Scamp5Q9JKD3 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Scamp5Q9JKD3 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Scamp5Q9JKD3 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Scamp5Q9JKD3 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Scamp5Q9JKD3 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Scamp5Q9JKD3 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Scamp5Q9JKD3 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Scamp5Q9JKD3 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Scamp5Q9JKD3 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Scamp5Q9JKD3 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Scamp5Q9JKD3 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Scamp5Q9JKD3 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Scamp5Q9JKD3 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Scamp5Q9JKD3 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Scamp5Q9JKD3 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms