Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ8

Cnga3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga3Q9JJZ8 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cnga3Q9JJZ8 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cnga3Q9JJZ8 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cnga3Q9JJZ8 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cnga3Q9JJZ8 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cnga3Q9JJZ8 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cnga3Q9JJZ8 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cnga3Q9JJZ8 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cnga3Q9JJZ8 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cnga3Q9JJZ8 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Cnga3Q9JJZ8 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cnga3Q9JJZ8 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cnga3Q9JJZ8 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cnga3Q9JJZ8 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cnga3Q9JJZ8 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cnga3Q9JJZ8 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cnga3Q9JJZ8 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cnga3Q9JJZ8 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cnga3Q9JJZ8 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cnga3Q9JJZ8 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cnga3Q9JJZ8 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cnga3Q9JJZ8 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cnga3Q9JJZ8 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Cnga3Q9JJZ8 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cnga3Q9JJZ8 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cnga3Q9JJZ8 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Cnga3Q9JJZ8 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cnga3Q9JJZ8 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cnga3Q9JJZ8 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cnga3Q9JJZ8 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cnga3Q9JJZ8 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cnga3Q9JJZ8 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnga3Q9JJZ8 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnga3Q9JJZ8 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnga3Q9JJZ8 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnga3Q9JJZ8 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnga3Q9JJZ8 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnga3Q9JJZ8 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnga3Q9JJZ8 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnga3Q9JJZ8 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnga3Q9JJZ8 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnga3Q9JJZ8 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnga3Q9JJZ8 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnga3Q9JJZ8 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnga3Q9JJZ8 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnga3Q9JJZ8 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnga3Q9JJZ8 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cnga3Q9JJZ8 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cnga3Q9JJZ8 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cnga3Q9JJZ8 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cnga3Q9JJZ8 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cnga3Q9JJZ8 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cnga3Q9JJZ8 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cnga3Q9JJZ8 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cnga3Q9JJZ8 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cnga3Q9JJZ8 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cnga3Q9JJZ8 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cnga3Q9JJZ8 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cnga3Q9JJZ8 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cnga3Q9JJZ8 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnga3Q9JJZ8 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnga3Q9JJZ8 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnga3Q9JJZ8 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnga3Q9JJZ8 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnga3Q9JJZ8 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnga3Q9JJZ8 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnga3Q9JJZ8 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnga3Q9JJZ8 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnga3Q9JJZ8 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnga3Q9JJZ8 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnga3Q9JJZ8 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnga3Q9JJZ8 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnga3Q9JJZ8 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnga3Q9JJZ8 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnga3Q9JJZ8 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnga3Q9JJZ8 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnga3Q9JJZ8 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnga3Q9JJZ8 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnga3Q9JJZ8 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnga3Q9JJZ8 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnga3Q9JJZ8 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnga3Q9JJZ8 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnga3Q9JJZ8 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnga3Q9JJZ8 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnga3Q9JJZ8 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnga3Q9JJZ8 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnga3Q9JJZ8 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnga3Q9JJZ8 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnga3Q9JJZ8 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnga3Q9JJZ8 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cnga3Q9JJZ8 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cnga3Q9JJZ8 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cnga3Q9JJZ8 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cnga3Q9JJZ8 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cnga3Q9JJZ8 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cnga3Q9JJZ8 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cnga3Q9JJZ8 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cnga3Q9JJZ8 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cnga3Q9JJZ8 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cnga3Q9JJZ8 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms