Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJY3

Smpd3, Sphingomyelin phosphodiesterase 3, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd3Q9JJY3 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smpd3Q9JJY3 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smpd3Q9JJY3 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smpd3Q9JJY3 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smpd3Q9JJY3 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smpd3Q9JJY3 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smpd3Q9JJY3 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smpd3Q9JJY3 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smpd3Q9JJY3 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smpd3Q9JJY3 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smpd3Q9JJY3 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smpd3Q9JJY3 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Smpd3Q9JJY3 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Smpd3Q9JJY3 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smpd3Q9JJY3 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smpd3Q9JJY3 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smpd3Q9JJY3 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smpd3Q9JJY3 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smpd3Q9JJY3 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smpd3Q9JJY3 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smpd3Q9JJY3 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smpd3Q9JJY3 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smpd3Q9JJY3 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smpd3Q9JJY3 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smpd3Q9JJY3 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smpd3Q9JJY3 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smpd3Q9JJY3 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smpd3Q9JJY3 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smpd3Q9JJY3 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smpd3Q9JJY3 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smpd3Q9JJY3 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smpd3Q9JJY3 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smpd3Q9JJY3 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smpd3Q9JJY3 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smpd3Q9JJY3 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smpd3Q9JJY3 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smpd3Q9JJY3 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smpd3Q9JJY3 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smpd3Q9JJY3 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smpd3Q9JJY3 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smpd3Q9JJY3 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smpd3Q9JJY3 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smpd3Q9JJY3 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smpd3Q9JJY3 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Smpd3Q9JJY3 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smpd3Q9JJY3 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smpd3Q9JJY3 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smpd3Q9JJY3 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smpd3Q9JJY3 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smpd3Q9JJY3 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smpd3Q9JJY3 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smpd3Q9JJY3 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smpd3Q9JJY3 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smpd3Q9JJY3 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smpd3Q9JJY3 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smpd3Q9JJY3 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smpd3Q9JJY3 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smpd3Q9JJY3 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smpd3Q9JJY3 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smpd3Q9JJY3 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smpd3Q9JJY3 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smpd3Q9JJY3 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smpd3Q9JJY3 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smpd3Q9JJY3 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Smpd3Q9JJY3 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smpd3Q9JJY3 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Smpd3Q9JJY3 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smpd3Q9JJY3 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smpd3Q9JJY3 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smpd3Q9JJY3 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smpd3Q9JJY3 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smpd3Q9JJY3 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Smpd3Q9JJY3 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Smpd3Q9JJY3 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Smpd3Q9JJY3 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Smpd3Q9JJY3 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Smpd3Q9JJY3 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Smpd3Q9JJY3 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Smpd3Q9JJY3 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Smpd3Q9JJY3 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smpd3Q9JJY3 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smpd3Q9JJY3 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Smpd3Q9JJY3 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smpd3Q9JJY3 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smpd3Q9JJY3 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smpd3Q9JJY3 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smpd3Q9JJY3 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smpd3Q9JJY3 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smpd3Q9JJY3 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smpd3Q9JJY3 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smpd3Q9JJY3 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smpd3Q9JJY3 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smpd3Q9JJY3 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smpd3Q9JJY3 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smpd3Q9JJY3 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smpd3Q9JJY3 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smpd3Q9JJY3 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smpd3Q9JJY3 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smpd3Q9JJY3 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smpd3Q9JJY3 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms