Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJN6

Ctnnbip1, Beta-catenin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnbip1Q9JJN6 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ctnnbip1Q9JJN6 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ctnnbip1Q9JJN6 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ctnnbip1Q9JJN6 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ctnnbip1Q9JJN6 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ctnnbip1Q9JJN6 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ctnnbip1Q9JJN6 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ctnnbip1Q9JJN6 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ctnnbip1Q9JJN6 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ctnnbip1Q9JJN6 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ctnnbip1Q9JJN6 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ctnnbip1Q9JJN6 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ctnnbip1Q9JJN6 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ctnnbip1Q9JJN6 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ctnnbip1Q9JJN6 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ctnnbip1Q9JJN6 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ctnnbip1Q9JJN6 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ctnnbip1Q9JJN6 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ctnnbip1Q9JJN6 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ctnnbip1Q9JJN6 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ctnnbip1Q9JJN6 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ctnnbip1Q9JJN6 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ctnnbip1Q9JJN6 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ctnnbip1Q9JJN6 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ctnnbip1Q9JJN6 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ctnnbip1Q9JJN6 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ctnnbip1Q9JJN6 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ctnnbip1Q9JJN6 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ctnnbip1Q9JJN6 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ctnnbip1Q9JJN6 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ctnnbip1Q9JJN6 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ctnnbip1Q9JJN6 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ctnnbip1Q9JJN6 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ctnnbip1Q9JJN6 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ctnnbip1Q9JJN6 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ctnnbip1Q9JJN6 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ctnnbip1Q9JJN6 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ctnnbip1Q9JJN6 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ctnnbip1Q9JJN6 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ctnnbip1Q9JJN6 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ctnnbip1Q9JJN6 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ctnnbip1Q9JJN6 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ctnnbip1Q9JJN6 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ctnnbip1Q9JJN6 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ctnnbip1Q9JJN6 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
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