Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ89

Ccdc86, Coiled-coil domain-containing protein 86, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc86Q9JJ89 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc86Q9JJ89 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc86Q9JJ89 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc86Q9JJ89 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc86Q9JJ89 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc86Q9JJ89 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc86Q9JJ89 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc86Q9JJ89 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc86Q9JJ89 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc86Q9JJ89 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc86Q9JJ89 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc86Q9JJ89 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc86Q9JJ89 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc86Q9JJ89 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc86Q9JJ89 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc86Q9JJ89 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc86Q9JJ89 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc86Q9JJ89 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc86Q9JJ89 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc86Q9JJ89 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc86Q9JJ89 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc86Q9JJ89 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc86Q9JJ89 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc86Q9JJ89 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc86Q9JJ89 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc86Q9JJ89 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc86Q9JJ89 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc86Q9JJ89 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc86Q9JJ89 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc86Q9JJ89 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc86Q9JJ89 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc86Q9JJ89 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc86Q9JJ89 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc86Q9JJ89 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc86Q9JJ89 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc86Q9JJ89 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc86Q9JJ89 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc86Q9JJ89 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc86Q9JJ89 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc86Q9JJ89 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc86Q9JJ89 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc86Q9JJ89 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc86Q9JJ89 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc86Q9JJ89 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc86Q9JJ89 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc86Q9JJ89 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc86Q9JJ89 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc86Q9JJ89 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc86Q9JJ89 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc86Q9JJ89 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc86Q9JJ89 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc86Q9JJ89 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc86Q9JJ89 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc86Q9JJ89 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc86Q9JJ89 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc86Q9JJ89 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc86Q9JJ89 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc86Q9JJ89 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc86Q9JJ89 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc86Q9JJ89 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc86Q9JJ89 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc86Q9JJ89 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc86Q9JJ89 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc86Q9JJ89 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc86Q9JJ89 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc86Q9JJ89 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc86Q9JJ89 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc86Q9JJ89 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc86Q9JJ89 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc86Q9JJ89 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc86Q9JJ89 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc86Q9JJ89 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc86Q9JJ89 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc86Q9JJ89 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc86Q9JJ89 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc86Q9JJ89 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc86Q9JJ89 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc86Q9JJ89 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc86Q9JJ89 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc86Q9JJ89 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc86Q9JJ89 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc86Q9JJ89 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc86Q9JJ89 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc86Q9JJ89 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc86Q9JJ89 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc86Q9JJ89 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc86Q9JJ89 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc86Q9JJ89 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc86Q9JJ89 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc86Q9JJ89 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc86Q9JJ89 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc86Q9JJ89 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc86Q9JJ89 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc86Q9JJ89 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc86Q9JJ89 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc86Q9JJ89 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc86Q9JJ89 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc86Q9JJ89 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc86Q9JJ89 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc86Q9JJ89 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms