Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ57

Kcnip1, Kv channel-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip1Q9JJ57 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Kcnip1Q9JJ57 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Kcnip1Q9JJ57 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Kcnip1Q9JJ57 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Kcnip1Q9JJ57 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Kcnip1Q9JJ57 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Kcnip1Q9JJ57 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Kcnip1Q9JJ57 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Kcnip1Q9JJ57 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Kcnip1Q9JJ57 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Kcnip1Q9JJ57 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Kcnip1Q9JJ57 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Kcnip1Q9JJ57 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Kcnip1Q9JJ57 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Kcnip1Q9JJ57 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Kcnip1Q9JJ57 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Kcnip1Q9JJ57 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Kcnip1Q9JJ57 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Kcnip1Q9JJ57 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Kcnip1Q9JJ57 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Kcnip1Q9JJ57 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnip1Q9JJ57 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnip1Q9JJ57 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnip1Q9JJ57 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnip1Q9JJ57 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnip1Q9JJ57 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnip1Q9JJ57 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnip1Q9JJ57 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnip1Q9JJ57 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnip1Q9JJ57 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnip1Q9JJ57 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnip1Q9JJ57 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnip1Q9JJ57 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnip1Q9JJ57 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnip1Q9JJ57 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnip1Q9JJ57 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnip1Q9JJ57 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnip1Q9JJ57 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnip1Q9JJ57 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Kcnip1Q9JJ57 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnip1Q9JJ57 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnip1Q9JJ57 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
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Kcnip1Q9JJ57 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnip1Q9JJ57 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Kcnip1Q9JJ57 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Kcnip1Q9JJ57 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kcnip1Q9JJ57 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kcnip1Q9JJ57 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kcnip1Q9JJ57 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Kcnip1Q9JJ57 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kcnip1Q9JJ57 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kcnip1Q9JJ57 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kcnip1Q9JJ57 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kcnip1Q9JJ57 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kcnip1Q9JJ57 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kcnip1Q9JJ57 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kcnip1Q9JJ57 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kcnip1Q9JJ57 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kcnip1Q9JJ57 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Kcnip1Q9JJ57 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kcnip1Q9JJ57 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kcnip1Q9JJ57 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kcnip1Q9JJ57 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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