Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS5

Sv2a, Synaptic vesicle glycoprotein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sv2aQ9JIS5 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sv2aQ9JIS5 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sv2aQ9JIS5 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sv2aQ9JIS5 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sv2aQ9JIS5 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sv2aQ9JIS5 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sv2aQ9JIS5 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sv2aQ9JIS5 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sv2aQ9JIS5 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sv2aQ9JIS5 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sv2aQ9JIS5 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sv2aQ9JIS5 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sv2aQ9JIS5 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sv2aQ9JIS5 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sv2aQ9JIS5 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sv2aQ9JIS5 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sv2aQ9JIS5 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sv2aQ9JIS5 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sv2aQ9JIS5 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sv2aQ9JIS5 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sv2aQ9JIS5 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sv2aQ9JIS5 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sv2aQ9JIS5 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sv2aQ9JIS5 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sv2aQ9JIS5 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sv2aQ9JIS5 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sv2aQ9JIS5 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sv2aQ9JIS5 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sv2aQ9JIS5 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Sv2aQ9JIS5 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sv2aQ9JIS5 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sv2aQ9JIS5 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sv2aQ9JIS5 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sv2aQ9JIS5 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sv2aQ9JIS5 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sv2aQ9JIS5 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sv2aQ9JIS5 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sv2aQ9JIS5 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sv2aQ9JIS5 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sv2aQ9JIS5 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sv2aQ9JIS5 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sv2aQ9JIS5 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sv2aQ9JIS5 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sv2aQ9JIS5 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sv2aQ9JIS5 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sv2aQ9JIS5 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sv2aQ9JIS5 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sv2aQ9JIS5 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sv2aQ9JIS5 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sv2aQ9JIS5 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sv2aQ9JIS5 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sv2aQ9JIS5 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sv2aQ9JIS5 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sv2aQ9JIS5 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sv2aQ9JIS5 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sv2aQ9JIS5 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sv2aQ9JIS5 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sv2aQ9JIS5 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sv2aQ9JIS5 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sv2aQ9JIS5 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sv2aQ9JIS5 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sv2aQ9JIS5 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sv2aQ9JIS5 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Sv2aQ9JIS5 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sv2aQ9JIS5 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sv2aQ9JIS5 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sv2aQ9JIS5 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sv2aQ9JIS5 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sv2aQ9JIS5 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sv2aQ9JIS5 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sv2aQ9JIS5 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sv2aQ9JIS5 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sv2aQ9JIS5 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sv2aQ9JIS5 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sv2aQ9JIS5 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sv2aQ9JIS5 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sv2aQ9JIS5 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sv2aQ9JIS5 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sv2aQ9JIS5 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sv2aQ9JIS5 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sv2aQ9JIS5 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sv2aQ9JIS5 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Sv2aQ9JIS5 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sv2aQ9JIS5 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sv2aQ9JIS5 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Sv2aQ9JIS5 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sv2aQ9JIS5 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Sv2aQ9JIS5 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sv2aQ9JIS5 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sv2aQ9JIS5 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sv2aQ9JIS5 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sv2aQ9JIS5 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sv2aQ9JIS5 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sv2aQ9JIS5 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sv2aQ9JIS5 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sv2aQ9JIS5 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sv2aQ9JIS5 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sv2aQ9JIS5 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sv2aQ9JIS5 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sv2aQ9JIS5 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.8 ms