Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIL5

Tulp4, Tubby-related protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tulp4Q9JIL5 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tulp4Q9JIL5 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tulp4Q9JIL5 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tulp4Q9JIL5 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tulp4Q9JIL5 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tulp4Q9JIL5 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tulp4Q9JIL5 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tulp4Q9JIL5 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tulp4Q9JIL5 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Tulp4Q9JIL5 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tulp4Q9JIL5 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tulp4Q9JIL5 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tulp4Q9JIL5 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tulp4Q9JIL5 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tulp4Q9JIL5 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tulp4Q9JIL5 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tulp4Q9JIL5 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tulp4Q9JIL5 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tulp4Q9JIL5 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tulp4Q9JIL5 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tulp4Q9JIL5 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tulp4Q9JIL5 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tulp4Q9JIL5 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tulp4Q9JIL5 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tulp4Q9JIL5 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tulp4Q9JIL5 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tulp4Q9JIL5 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tulp4Q9JIL5 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tulp4Q9JIL5 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tulp4Q9JIL5 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tulp4Q9JIL5 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Tulp4Q9JIL5 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tulp4Q9JIL5 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Tulp4Q9JIL5 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tulp4Q9JIL5 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tulp4Q9JIL5 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tulp4Q9JIL5 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tulp4Q9JIL5 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tulp4Q9JIL5 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tulp4Q9JIL5 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Tulp4Q9JIL5 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tulp4Q9JIL5 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tulp4Q9JIL5 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tulp4Q9JIL5 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tulp4Q9JIL5 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tulp4Q9JIL5 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tulp4Q9JIL5 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tulp4Q9JIL5 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tulp4Q9JIL5 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tulp4Q9JIL5 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Tulp4Q9JIL5 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tulp4Q9JIL5 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tulp4Q9JIL5 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tulp4Q9JIL5 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Tulp4Q9JIL5 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tulp4Q9JIL5 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Tulp4Q9JIL5 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Tulp4Q9JIL5 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tulp4Q9JIL5 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tulp4Q9JIL5 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tulp4Q9JIL5 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tulp4Q9JIL5 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tulp4Q9JIL5 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tulp4Q9JIL5 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tulp4Q9JIL5 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tulp4Q9JIL5 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tulp4Q9JIL5 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tulp4Q9JIL5 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tulp4Q9JIL5 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tulp4Q9JIL5 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tulp4Q9JIL5 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tulp4Q9JIL5 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tulp4Q9JIL5 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tulp4Q9JIL5 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tulp4Q9JIL5 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tulp4Q9JIL5 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tulp4Q9JIL5 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tulp4Q9JIL5 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tulp4Q9JIL5 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tulp4Q9JIL5 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tulp4Q9JIL5 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tulp4Q9JIL5 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tulp4Q9JIL5 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tulp4Q9JIL5 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tulp4Q9JIL5 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tulp4Q9JIL5 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tulp4Q9JIL5 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tulp4Q9JIL5 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Tulp4Q9JIL5 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tulp4Q9JIL5 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tulp4Q9JIL5 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tulp4Q9JIL5 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Tulp4Q9JIL5 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tulp4Q9JIL5 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tulp4Q9JIL5 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tulp4Q9JIL5 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tulp4Q9JIL5 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tulp4Q9JIL5 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tulp4Q9JIL5 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tulp4Q9JIL5 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms