Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI57

Gtf2ird1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2ird1Q9JI57 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtf2ird1Q9JI57 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtf2ird1Q9JI57 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gtf2ird1Q9JI57 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gtf2ird1Q9JI57 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gtf2ird1Q9JI57 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gtf2ird1Q9JI57 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Gtf2ird1Q9JI57 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gtf2ird1Q9JI57 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gtf2ird1Q9JI57 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gtf2ird1Q9JI57 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gtf2ird1Q9JI57 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gtf2ird1Q9JI57 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gtf2ird1Q9JI57 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gtf2ird1Q9JI57 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gtf2ird1Q9JI57 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtf2ird1Q9JI57 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtf2ird1Q9JI57 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtf2ird1Q9JI57 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtf2ird1Q9JI57 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtf2ird1Q9JI57 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtf2ird1Q9JI57 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtf2ird1Q9JI57 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtf2ird1Q9JI57 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtf2ird1Q9JI57 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtf2ird1Q9JI57 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtf2ird1Q9JI57 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtf2ird1Q9JI57 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtf2ird1Q9JI57 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gtf2ird1Q9JI57 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gtf2ird1Q9JI57 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gtf2ird1Q9JI57 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gtf2ird1Q9JI57 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gtf2ird1Q9JI57 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gtf2ird1Q9JI57 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gtf2ird1Q9JI57 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gtf2ird1Q9JI57 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gtf2ird1Q9JI57 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gtf2ird1Q9JI57 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gtf2ird1Q9JI57 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gtf2ird1Q9JI57 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gtf2ird1Q9JI57 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gtf2ird1Q9JI57 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gtf2ird1Q9JI57 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gtf2ird1Q9JI57 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gtf2ird1Q9JI57 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gtf2ird1Q9JI57 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gtf2ird1Q9JI57 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gtf2ird1Q9JI57 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gtf2ird1Q9JI57 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gtf2ird1Q9JI57 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gtf2ird1Q9JI57 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gtf2ird1Q9JI57 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gtf2ird1Q9JI57 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gtf2ird1Q9JI57 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gtf2ird1Q9JI57 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gtf2ird1Q9JI57 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gtf2ird1Q9JI57 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gtf2ird1Q9JI57 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gtf2ird1Q9JI57 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gtf2ird1Q9JI57 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gtf2ird1Q9JI57 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gtf2ird1Q9JI57 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gtf2ird1Q9JI57 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtf2ird1Q9JI57 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtf2ird1Q9JI57 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtf2ird1Q9JI57 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtf2ird1Q9JI57 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtf2ird1Q9JI57 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtf2ird1Q9JI57 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtf2ird1Q9JI57 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtf2ird1Q9JI57 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtf2ird1Q9JI57 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtf2ird1Q9JI57 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtf2ird1Q9JI57 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtf2ird1Q9JI57 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtf2ird1Q9JI57 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtf2ird1Q9JI57 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtf2ird1Q9JI57 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtf2ird1Q9JI57 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtf2ird1Q9JI57 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtf2ird1Q9JI57 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtf2ird1Q9JI57 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtf2ird1Q9JI57 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtf2ird1Q9JI57 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtf2ird1Q9JI57 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtf2ird1Q9JI57 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtf2ird1Q9JI57 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtf2ird1Q9JI57 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtf2ird1Q9JI57 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtf2ird1Q9JI57 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtf2ird1Q9JI57 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtf2ird1Q9JI57 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtf2ird1Q9JI57 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtf2ird1Q9JI57 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtf2ird1Q9JI57 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtf2ird1Q9JI57 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtf2ird1Q9JI57 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtf2ird1Q9JI57 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtf2ird1Q9JI57 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms