Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHF5

Tcirg1, V-type proton ATPase subunit a, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcirg1Q9JHF5 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tcirg1Q9JHF5 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tcirg1Q9JHF5 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tcirg1Q9JHF5 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tcirg1Q9JHF5 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Tcirg1Q9JHF5 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tcirg1Q9JHF5 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tcirg1Q9JHF5 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tcirg1Q9JHF5 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tcirg1Q9JHF5 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tcirg1Q9JHF5 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tcirg1Q9JHF5 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tcirg1Q9JHF5 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tcirg1Q9JHF5 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tcirg1Q9JHF5 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tcirg1Q9JHF5 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tcirg1Q9JHF5 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tcirg1Q9JHF5 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tcirg1Q9JHF5 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tcirg1Q9JHF5 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tcirg1Q9JHF5 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tcirg1Q9JHF5 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tcirg1Q9JHF5 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tcirg1Q9JHF5 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tcirg1Q9JHF5 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tcirg1Q9JHF5 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tcirg1Q9JHF5 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tcirg1Q9JHF5 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Tcirg1Q9JHF5 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tcirg1Q9JHF5 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tcirg1Q9JHF5 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tcirg1Q9JHF5 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tcirg1Q9JHF5 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tcirg1Q9JHF5 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tcirg1Q9JHF5 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tcirg1Q9JHF5 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tcirg1Q9JHF5 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tcirg1Q9JHF5 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tcirg1Q9JHF5 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tcirg1Q9JHF5 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tcirg1Q9JHF5 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tcirg1Q9JHF5 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tcirg1Q9JHF5 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tcirg1Q9JHF5 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tcirg1Q9JHF5 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tcirg1Q9JHF5 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tcirg1Q9JHF5 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tcirg1Q9JHF5 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Tcirg1Q9JHF5 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tcirg1Q9JHF5 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tcirg1Q9JHF5 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tcirg1Q9JHF5 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tcirg1Q9JHF5 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tcirg1Q9JHF5 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tcirg1Q9JHF5 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tcirg1Q9JHF5 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tcirg1Q9JHF5 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tcirg1Q9JHF5 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tcirg1Q9JHF5 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tcirg1Q9JHF5 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tcirg1Q9JHF5 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Tcirg1Q9JHF5 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tcirg1Q9JHF5 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tcirg1Q9JHF5 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tcirg1Q9JHF5 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tcirg1Q9JHF5 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tcirg1Q9JHF5 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tcirg1Q9JHF5 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tcirg1Q9JHF5 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Tcirg1Q9JHF5 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tcirg1Q9JHF5 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tcirg1Q9JHF5 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tcirg1Q9JHF5 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tcirg1Q9JHF5 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tcirg1Q9JHF5 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tcirg1Q9JHF5 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tcirg1Q9JHF5 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tcirg1Q9JHF5 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tcirg1Q9JHF5 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tcirg1Q9JHF5 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tcirg1Q9JHF5 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tcirg1Q9JHF5 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tcirg1Q9JHF5 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tcirg1Q9JHF5 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tcirg1Q9JHF5 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tcirg1Q9JHF5 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tcirg1Q9JHF5 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tcirg1Q9JHF5 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Tcirg1Q9JHF5 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tcirg1Q9JHF5 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tcirg1Q9JHF5 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Tcirg1Q9JHF5 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tcirg1Q9JHF5 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tcirg1Q9JHF5 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tcirg1Q9JHF5 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tcirg1Q9JHF5 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tcirg1Q9JHF5 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tcirg1Q9JHF5 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tcirg1Q9JHF5 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tcirg1Q9JHF5 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms