Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET38

Cldn19, Claudin-19, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn19Q9ET38 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
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Cldn19Q9ET38 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cldn19Q9ET38 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cldn19Q9ET38 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cldn19Q9ET38 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cldn19Q9ET38 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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Cldn19Q9ET38 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cldn19Q9ET38 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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Cldn19Q9ET38 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
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Cldn19Q9ET38 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cldn19Q9ET38 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cldn19Q9ET38 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cldn19Q9ET38 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
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Cldn19Q9ET38 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cldn19Q9ET38 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cldn19Q9ET38 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cldn19Q9ET38 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
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Cldn19Q9ET38 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Cldn19Q9ET38 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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Cldn19Q9ET38 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cldn19Q9ET38 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Cldn19Q9ET38 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Cldn19Q9ET38 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cldn19Q9ET38 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cldn19Q9ET38 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cldn19Q9ET38 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cldn19Q9ET38 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cldn19Q9ET38 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cldn19Q9ET38 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cldn19Q9ET38 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cldn19Q9ET38 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cldn19Q9ET38 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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Cldn19Q9ET38 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cldn19Q9ET38 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cldn19Q9ET38 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
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Cldn19Q9ET38 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cldn19Q9ET38 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Cldn19Q9ET38 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cldn19Q9ET38 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Cldn19Q9ET38 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cldn19Q9ET38 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cldn19Q9ET38 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cldn19Q9ET38 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cldn19Q9ET38 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
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Cldn19Q9ET38 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cldn19Q9ET38 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cldn19Q9ET38 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cldn19Q9ET38 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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Cldn19Q9ET38 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cldn19Q9ET38 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cldn19Q9ET38 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cldn19Q9ET38 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
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Cldn19Q9ET38 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cldn19Q9ET38 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cldn19Q9ET38 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cldn19Q9ET38 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cldn19Q9ET38 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cldn19Q9ET38 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cldn19Q9ET38 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cldn19Q9ET38 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cldn19Q9ET38 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Cldn19Q9ET38 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cldn19Q9ET38 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cldn19Q9ET38 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cldn19Q9ET38 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cldn19Q9ET38 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cldn19Q9ET38 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cldn19Q9ET38 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cldn19Q9ET38 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cldn19Q9ET38 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cldn19Q9ET38 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cldn19Q9ET38 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cldn19Q9ET38 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cldn19Q9ET38 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cldn19Q9ET38 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cldn19Q9ET38 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cldn19Q9ET38 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Cldn19Q9ET38 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn19Q9ET38 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn19Q9ET38 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn19Q9ET38 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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