Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERH7

Hipk3, Homeodomain-interacting protein kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hipk3Q9ERH7 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hipk3Q9ERH7 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hipk3Q9ERH7 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hipk3Q9ERH7 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hipk3Q9ERH7 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hipk3Q9ERH7 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hipk3Q9ERH7 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hipk3Q9ERH7 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Hipk3Q9ERH7 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hipk3Q9ERH7 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hipk3Q9ERH7 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hipk3Q9ERH7 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hipk3Q9ERH7 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hipk3Q9ERH7 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Hipk3Q9ERH7 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hipk3Q9ERH7 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hipk3Q9ERH7 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hipk3Q9ERH7 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hipk3Q9ERH7 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hipk3Q9ERH7 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hipk3Q9ERH7 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hipk3Q9ERH7 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hipk3Q9ERH7 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hipk3Q9ERH7 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hipk3Q9ERH7 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hipk3Q9ERH7 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hipk3Q9ERH7 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hipk3Q9ERH7 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hipk3Q9ERH7 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Hipk3Q9ERH7 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hipk3Q9ERH7 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hipk3Q9ERH7 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hipk3Q9ERH7 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Hipk3Q9ERH7 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hipk3Q9ERH7 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hipk3Q9ERH7 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hipk3Q9ERH7 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hipk3Q9ERH7 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hipk3Q9ERH7 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Hipk3Q9ERH7 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hipk3Q9ERH7 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Hipk3Q9ERH7 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hipk3Q9ERH7 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hipk3Q9ERH7 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hipk3Q9ERH7 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hipk3Q9ERH7 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hipk3Q9ERH7 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hipk3Q9ERH7 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hipk3Q9ERH7 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hipk3Q9ERH7 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hipk3Q9ERH7 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Hipk3Q9ERH7 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hipk3Q9ERH7 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hipk3Q9ERH7 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hipk3Q9ERH7 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hipk3Q9ERH7 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hipk3Q9ERH7 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hipk3Q9ERH7 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hipk3Q9ERH7 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hipk3Q9ERH7 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hipk3Q9ERH7 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hipk3Q9ERH7 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hipk3Q9ERH7 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hipk3Q9ERH7 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hipk3Q9ERH7 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hipk3Q9ERH7 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hipk3Q9ERH7 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hipk3Q9ERH7 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hipk3Q9ERH7 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hipk3Q9ERH7 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hipk3Q9ERH7 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hipk3Q9ERH7 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hipk3Q9ERH7 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hipk3Q9ERH7 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hipk3Q9ERH7 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hipk3Q9ERH7 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hipk3Q9ERH7 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hipk3Q9ERH7 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hipk3Q9ERH7 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Hipk3Q9ERH7 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hipk3Q9ERH7 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hipk3Q9ERH7 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hipk3Q9ERH7 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Hipk3Q9ERH7 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Hipk3Q9ERH7 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hipk3Q9ERH7 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hipk3Q9ERH7 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hipk3Q9ERH7 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hipk3Q9ERH7 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hipk3Q9ERH7 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hipk3Q9ERH7 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hipk3Q9ERH7 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hipk3Q9ERH7 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hipk3Q9ERH7 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hipk3Q9ERH7 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hipk3Q9ERH7 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hipk3Q9ERH7 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hipk3Q9ERH7 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hipk3Q9ERH7 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hipk3Q9ERH7 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms