Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERG0

Lima1, LIM domain and actin-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lima1Q9ERG0 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lima1Q9ERG0 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lima1Q9ERG0 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lima1Q9ERG0 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lima1Q9ERG0 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lima1Q9ERG0 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lima1Q9ERG0 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lima1Q9ERG0 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lima1Q9ERG0 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lima1Q9ERG0 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lima1Q9ERG0 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lima1Q9ERG0 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lima1Q9ERG0 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lima1Q9ERG0 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lima1Q9ERG0 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lima1Q9ERG0 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lima1Q9ERG0 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lima1Q9ERG0 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lima1Q9ERG0 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lima1Q9ERG0 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Lima1Q9ERG0 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lima1Q9ERG0 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lima1Q9ERG0 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lima1Q9ERG0 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lima1Q9ERG0 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lima1Q9ERG0 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lima1Q9ERG0 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lima1Q9ERG0 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lima1Q9ERG0 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lima1Q9ERG0 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lima1Q9ERG0 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lima1Q9ERG0 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lima1Q9ERG0 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Lima1Q9ERG0 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Lima1Q9ERG0 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lima1Q9ERG0 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lima1Q9ERG0 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lima1Q9ERG0 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lima1Q9ERG0 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lima1Q9ERG0 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lima1Q9ERG0 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lima1Q9ERG0 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lima1Q9ERG0 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lima1Q9ERG0 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lima1Q9ERG0 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Lima1Q9ERG0 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Lima1Q9ERG0 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lima1Q9ERG0 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lima1Q9ERG0 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lima1Q9ERG0 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lima1Q9ERG0 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lima1Q9ERG0 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lima1Q9ERG0 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lima1Q9ERG0 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lima1Q9ERG0 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lima1Q9ERG0 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lima1Q9ERG0 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lima1Q9ERG0 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Lima1Q9ERG0 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Lima1Q9ERG0 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lima1Q9ERG0 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lima1Q9ERG0 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lima1Q9ERG0 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lima1Q9ERG0 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lima1Q9ERG0 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lima1Q9ERG0 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lima1Q9ERG0 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lima1Q9ERG0 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lima1Q9ERG0 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lima1Q9ERG0 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lima1Q9ERG0 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lima1Q9ERG0 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lima1Q9ERG0 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lima1Q9ERG0 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lima1Q9ERG0 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lima1Q9ERG0 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lima1Q9ERG0 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lima1Q9ERG0 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lima1Q9ERG0 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lima1Q9ERG0 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lima1Q9ERG0 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lima1Q9ERG0 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lima1Q9ERG0 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Lima1Q9ERG0 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Lima1Q9ERG0 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Lima1Q9ERG0 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lima1Q9ERG0 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lima1Q9ERG0 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lima1Q9ERG0 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lima1Q9ERG0 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lima1Q9ERG0 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lima1Q9ERG0 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lima1Q9ERG0 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lima1Q9ERG0 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lima1Q9ERG0 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lima1Q9ERG0 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lima1Q9ERG0 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lima1Q9ERG0 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lima1Q9ERG0 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lima1Q9ERG0 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms