Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERD7

Tubb3, Tubulin beta-3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb3Q9ERD7 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Tubb3Q9ERD7 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tubb3Q9ERD7 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tubb3Q9ERD7 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tubb3Q9ERD7 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tubb3Q9ERD7 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tubb3Q9ERD7 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tubb3Q9ERD7 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tubb3Q9ERD7 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Tubb3Q9ERD7 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tubb3Q9ERD7 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tubb3Q9ERD7 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tubb3Q9ERD7 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tubb3Q9ERD7 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tubb3Q9ERD7 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tubb3Q9ERD7 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tubb3Q9ERD7 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tubb3Q9ERD7 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tubb3Q9ERD7 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tubb3Q9ERD7 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tubb3Q9ERD7 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tubb3Q9ERD7 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tubb3Q9ERD7 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tubb3Q9ERD7 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tubb3Q9ERD7 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tubb3Q9ERD7 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tubb3Q9ERD7 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tubb3Q9ERD7 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tubb3Q9ERD7 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tubb3Q9ERD7 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tubb3Q9ERD7 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tubb3Q9ERD7 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tubb3Q9ERD7 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tubb3Q9ERD7 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Tubb3Q9ERD7 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tubb3Q9ERD7 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Tubb3Q9ERD7 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tubb3Q9ERD7 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tubb3Q9ERD7 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Tubb3Q9ERD7 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tubb3Q9ERD7 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tubb3Q9ERD7 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tubb3Q9ERD7 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tubb3Q9ERD7 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tubb3Q9ERD7 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tubb3Q9ERD7 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tubb3Q9ERD7 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tubb3Q9ERD7 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tubb3Q9ERD7 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tubb3Q9ERD7 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tubb3Q9ERD7 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tubb3Q9ERD7 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tubb3Q9ERD7 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tubb3Q9ERD7 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tubb3Q9ERD7 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tubb3Q9ERD7 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tubb3Q9ERD7 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tubb3Q9ERD7 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tubb3Q9ERD7 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tubb3Q9ERD7 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tubb3Q9ERD7 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tubb3Q9ERD7 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tubb3Q9ERD7 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tubb3Q9ERD7 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tubb3Q9ERD7 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tubb3Q9ERD7 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tubb3Q9ERD7 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tubb3Q9ERD7 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tubb3Q9ERD7 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tubb3Q9ERD7 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Tubb3Q9ERD7 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tubb3Q9ERD7 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tubb3Q9ERD7 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tubb3Q9ERD7 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tubb3Q9ERD7 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tubb3Q9ERD7 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tubb3Q9ERD7 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Tubb3Q9ERD7 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tubb3Q9ERD7 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tubb3Q9ERD7 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tubb3Q9ERD7 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tubb3Q9ERD7 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Tubb3Q9ERD7 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tubb3Q9ERD7 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tubb3Q9ERD7 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tubb3Q9ERD7 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tubb3Q9ERD7 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tubb3Q9ERD7 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tubb3Q9ERD7 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tubb3Q9ERD7 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tubb3Q9ERD7 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tubb3Q9ERD7 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Tubb3Q9ERD7 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tubb3Q9ERD7 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tubb3Q9ERD7 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tubb3Q9ERD7 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tubb3Q9ERD7 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tubb3Q9ERD7 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tubb3Q9ERD7 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tubb3Q9ERD7 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms