Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERB5

Slco1c1, Solute carrier organic anion transporter family member 1C1, mousemouse

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slco1c1Q9ERB5 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slco1c1Q9ERB5 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slco1c1Q9ERB5 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slco1c1Q9ERB5 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slco1c1Q9ERB5 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slco1c1Q9ERB5 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slco1c1Q9ERB5 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slco1c1Q9ERB5 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slco1c1Q9ERB5 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Slco1c1Q9ERB5 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Slco1c1Q9ERB5 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Slco1c1Q9ERB5 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Slco1c1Q9ERB5 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Slco1c1Q9ERB5 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slco1c1Q9ERB5 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slco1c1Q9ERB5 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slco1c1Q9ERB5 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slco1c1Q9ERB5 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slco1c1Q9ERB5 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slco1c1Q9ERB5 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slco1c1Q9ERB5 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slco1c1Q9ERB5 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slco1c1Q9ERB5 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slco1c1Q9ERB5 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slco1c1Q9ERB5 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slco1c1Q9ERB5 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slco1c1Q9ERB5 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slco1c1Q9ERB5 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slco1c1Q9ERB5 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slco1c1Q9ERB5 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slco1c1Q9ERB5 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slco1c1Q9ERB5 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slco1c1Q9ERB5 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slco1c1Q9ERB5 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slco1c1Q9ERB5 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slco1c1Q9ERB5 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slco1c1Q9ERB5 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slco1c1Q9ERB5 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slco1c1Q9ERB5 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slco1c1Q9ERB5 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slco1c1Q9ERB5 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slco1c1Q9ERB5 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slco1c1Q9ERB5 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slco1c1Q9ERB5 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slco1c1Q9ERB5 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slco1c1Q9ERB5 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slco1c1Q9ERB5 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slco1c1Q9ERB5 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slco1c1Q9ERB5 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slco1c1Q9ERB5 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slco1c1Q9ERB5 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slco1c1Q9ERB5 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slco1c1Q9ERB5 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slco1c1Q9ERB5 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slco1c1Q9ERB5 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Slco1c1Q9ERB5 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slco1c1Q9ERB5 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slco1c1Q9ERB5 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slco1c1Q9ERB5 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slco1c1Q9ERB5 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slco1c1Q9ERB5 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slco1c1Q9ERB5 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slco1c1Q9ERB5 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slco1c1Q9ERB5 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slco1c1Q9ERB5 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slco1c1Q9ERB5 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slco1c1Q9ERB5 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slco1c1Q9ERB5 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Slco1c1Q9ERB5 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slco1c1Q9ERB5 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slco1c1Q9ERB5 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slco1c1Q9ERB5 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slco1c1Q9ERB5 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slco1c1Q9ERB5 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slco1c1Q9ERB5 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slco1c1Q9ERB5 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slco1c1Q9ERB5 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slco1c1Q9ERB5 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slco1c1Q9ERB5 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slco1c1Q9ERB5 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slco1c1Q9ERB5 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slco1c1Q9ERB5 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slco1c1Q9ERB5 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slco1c1Q9ERB5 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slco1c1Q9ERB5 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slco1c1Q9ERB5 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slco1c1Q9ERB5 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slco1c1Q9ERB5 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slco1c1Q9ERB5 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slco1c1Q9ERB5 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slco1c1Q9ERB5 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slco1c1Q9ERB5 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slco1c1Q9ERB5 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slco1c1Q9ERB5 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slco1c1Q9ERB5 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slco1c1Q9ERB5 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slco1c1Q9ERB5 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slco1c1Q9ERB5 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slco1c1Q9ERB5 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slco1c1Q9ERB5 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms