Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQR3

Kcnn1, Small conductance calcium-activated potassium channel protein 1, mousemouse

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Length 537 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnn1Q9EQR3 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Kcnn1Q9EQR3 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Kcnn1Q9EQR3 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Kcnn1Q9EQR3 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Kcnn1Q9EQR3 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Kcnn1Q9EQR3 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Kcnn1Q9EQR3 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Kcnn1Q9EQR3 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Kcnn1Q9EQR3 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Kcnn1Q9EQR3 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Kcnn1Q9EQR3 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Kcnn1Q9EQR3 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Kcnn1Q9EQR3 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Kcnn1Q9EQR3 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Kcnn1Q9EQR3 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Kcnn1Q9EQR3 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Kcnn1Q9EQR3 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Kcnn1Q9EQR3 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Kcnn1Q9EQR3 Gm14399-202ENSMUST00000108929 813 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Kcnn1Q9EQR3 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Kcnn1Q9EQR3 Gm45878-201ENSMUST00000211839 241 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Kcnn1Q9EQR3 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Kcnn1Q9EQR3 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Kcnn1Q9EQR3 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Kcnn1Q9EQR3 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Kcnn1Q9EQR3 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Kcnn1Q9EQR3 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Kcnn1Q9EQR3 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Kcnn1Q9EQR3 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Kcnn1Q9EQR3 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Kcnn1Q9EQR3 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Kcnn1Q9EQR3 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Kcnn1Q9EQR3 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Kcnn1Q9EQR3 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Kcnn1Q9EQR3 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Kcnn1Q9EQR3 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Kcnn1Q9EQR3 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Kcnn1Q9EQR3 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Kcnn1Q9EQR3 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Kcnn1Q9EQR3 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Kcnn1Q9EQR3 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Kcnn1Q9EQR3 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Kcnn1Q9EQR3 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Kcnn1Q9EQR3 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Kcnn1Q9EQR3 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Kcnn1Q9EQR3 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Kcnn1Q9EQR3 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Kcnn1Q9EQR3 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Kcnn1Q9EQR3 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Kcnn1Q9EQR3 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Kcnn1Q9EQR3 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Kcnn1Q9EQR3 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Kcnn1Q9EQR3 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Kcnn1Q9EQR3 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Kcnn1Q9EQR3 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Kcnn1Q9EQR3 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Kcnn1Q9EQR3 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Kcnn1Q9EQR3 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Kcnn1Q9EQR3 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Kcnn1Q9EQR3 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Kcnn1Q9EQR3 Gm6754-201ENSMUST00000117124 913 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Kcnn1Q9EQR3 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Kcnn1Q9EQR3 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Kcnn1Q9EQR3 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Kcnn1Q9EQR3 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Kcnn1Q9EQR3 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Kcnn1Q9EQR3 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Kcnn1Q9EQR3 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Kcnn1Q9EQR3 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Kcnn1Q9EQR3 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Kcnn1Q9EQR3 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Kcnn1Q9EQR3 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Kcnn1Q9EQR3 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Kcnn1Q9EQR3 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Kcnn1Q9EQR3 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Kcnn1Q9EQR3 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Kcnn1Q9EQR3 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Kcnn1Q9EQR3 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Kcnn1Q9EQR3 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Kcnn1Q9EQR3 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Kcnn1Q9EQR3 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Kcnn1Q9EQR3 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Kcnn1Q9EQR3 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Kcnn1Q9EQR3 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Kcnn1Q9EQR3 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Kcnn1Q9EQR3 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Kcnn1Q9EQR3 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Kcnn1Q9EQR3 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Kcnn1Q9EQR3 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Kcnn1Q9EQR3 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Kcnn1Q9EQR3 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Kcnn1Q9EQR3 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Kcnn1Q9EQR3 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Kcnn1Q9EQR3 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Kcnn1Q9EQR3 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Kcnn1Q9EQR3 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Kcnn1Q9EQR3 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Kcnn1Q9EQR3 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Kcnn1Q9EQR3 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kcnn1Q9EQR3 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms