Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ52

Vmn1r48, Vomeronasal type-1 receptor 48, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r48Q9EQ52 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r48Q9EQ52 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r48Q9EQ52 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r48Q9EQ52 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r48Q9EQ52 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r48Q9EQ52 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r48Q9EQ52 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r48Q9EQ52 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Vmn1r48Q9EQ52 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r48Q9EQ52 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r48Q9EQ52 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Vmn1r48Q9EQ52 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r48Q9EQ52 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r48Q9EQ52 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Vmn1r48Q9EQ52 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r48Q9EQ52 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Vmn1r48Q9EQ52 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r48Q9EQ52 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r48Q9EQ52 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r48Q9EQ52 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r48Q9EQ52 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r48Q9EQ52 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r48Q9EQ52 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r48Q9EQ52 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r48Q9EQ52 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r48Q9EQ52 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r48Q9EQ52 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r48Q9EQ52 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r48Q9EQ52 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r48Q9EQ52 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r48Q9EQ52 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r48Q9EQ52 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r48Q9EQ52 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r48Q9EQ52 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r48Q9EQ52 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Vmn1r48Q9EQ52 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Vmn1r48Q9EQ52 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r48Q9EQ52 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r48Q9EQ52 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r48Q9EQ52 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r48Q9EQ52 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r48Q9EQ52 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r48Q9EQ52 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r48Q9EQ52 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Vmn1r48Q9EQ52 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r48Q9EQ52 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Vmn1r48Q9EQ52 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r48Q9EQ52 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Vmn1r48Q9EQ52 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r48Q9EQ52 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r48Q9EQ52 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r48Q9EQ52 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r48Q9EQ52 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r48Q9EQ52 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r48Q9EQ52 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r48Q9EQ52 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r48Q9EQ52 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r48Q9EQ52 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r48Q9EQ52 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r48Q9EQ52 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r48Q9EQ52 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r48Q9EQ52 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r48Q9EQ52 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Vmn1r48Q9EQ52 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r48Q9EQ52 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r48Q9EQ52 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r48Q9EQ52 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r48Q9EQ52 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r48Q9EQ52 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r48Q9EQ52 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r48Q9EQ52 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Vmn1r48Q9EQ52 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r48Q9EQ52 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r48Q9EQ52 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r48Q9EQ52 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r48Q9EQ52 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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