Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ46

Vmn1r40, Vomeronasal type-1 receptor 40, mousemouse

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Length 310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r40Q9EQ46 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Vmn1r40Q9EQ46 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r40Q9EQ46 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Vmn1r40Q9EQ46 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Vmn1r40Q9EQ46 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
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Vmn1r40Q9EQ46 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r40Q9EQ46 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Vmn1r40Q9EQ46 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r40Q9EQ46 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r40Q9EQ46 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r40Q9EQ46 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r40Q9EQ46 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r40Q9EQ46 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r40Q9EQ46 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r40Q9EQ46 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r40Q9EQ46 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r40Q9EQ46 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r40Q9EQ46 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r40Q9EQ46 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r40Q9EQ46 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r40Q9EQ46 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r40Q9EQ46 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r40Q9EQ46 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r40Q9EQ46 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r40Q9EQ46 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r40Q9EQ46 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r40Q9EQ46 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r40Q9EQ46 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r40Q9EQ46 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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