Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ44

Vmn1r41, Vomeronasal type-1 receptor 41, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r41Q9EQ44 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r41Q9EQ44 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r41Q9EQ44 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r41Q9EQ44 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r41Q9EQ44 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r41Q9EQ44 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r41Q9EQ44 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r41Q9EQ44 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r41Q9EQ44 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r41Q9EQ44 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r41Q9EQ44 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r41Q9EQ44 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r41Q9EQ44 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r41Q9EQ44 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r41Q9EQ44 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r41Q9EQ44 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r41Q9EQ44 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r41Q9EQ44 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r41Q9EQ44 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r41Q9EQ44 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r41Q9EQ44 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r41Q9EQ44 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r41Q9EQ44 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r41Q9EQ44 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r41Q9EQ44 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r41Q9EQ44 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r41Q9EQ44 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r41Q9EQ44 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r41Q9EQ44 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r41Q9EQ44 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r41Q9EQ44 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r41Q9EQ44 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r41Q9EQ44 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r41Q9EQ44 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r41Q9EQ44 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r41Q9EQ44 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r41Q9EQ44 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r41Q9EQ44 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r41Q9EQ44 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r41Q9EQ44 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r41Q9EQ44 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r41Q9EQ44 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r41Q9EQ44 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r41Q9EQ44 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r41Q9EQ44 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r41Q9EQ44 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r41Q9EQ44 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r41Q9EQ44 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r41Q9EQ44 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r41Q9EQ44 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r41Q9EQ44 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r41Q9EQ44 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r41Q9EQ44 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r41Q9EQ44 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r41Q9EQ44 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r41Q9EQ44 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r41Q9EQ44 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r41Q9EQ44 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r41Q9EQ44 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Vmn1r41Q9EQ44 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r41Q9EQ44 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r41Q9EQ44 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r41Q9EQ44 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r41Q9EQ44 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Vmn1r41Q9EQ44 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r41Q9EQ44 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r41Q9EQ44 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Vmn1r41Q9EQ44 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Vmn1r41Q9EQ44 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r41Q9EQ44 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r41Q9EQ44 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Vmn1r41Q9EQ44 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r41Q9EQ44 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r41Q9EQ44 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r41Q9EQ44 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r41Q9EQ44 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r41Q9EQ44 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r41Q9EQ44 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r41Q9EQ44 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r41Q9EQ44 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r41Q9EQ44 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r41Q9EQ44 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r41Q9EQ44 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r41Q9EQ44 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r41Q9EQ44 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r41Q9EQ44 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r41Q9EQ44 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r41Q9EQ44 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r41Q9EQ44 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r41Q9EQ44 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r41Q9EQ44 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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