Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clstn1Q9EPL2 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clstn1Q9EPL2 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clstn1Q9EPL2 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clstn1Q9EPL2 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clstn1Q9EPL2 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clstn1Q9EPL2 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clstn1Q9EPL2 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clstn1Q9EPL2 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clstn1Q9EPL2 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clstn1Q9EPL2 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clstn1Q9EPL2 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clstn1Q9EPL2 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clstn1Q9EPL2 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clstn1Q9EPL2 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Clstn1Q9EPL2 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clstn1Q9EPL2 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clstn1Q9EPL2 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Clstn1Q9EPL2 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Clstn1Q9EPL2 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Clstn1Q9EPL2 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Clstn1Q9EPL2 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Clstn1Q9EPL2 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Clstn1Q9EPL2 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Clstn1Q9EPL2 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Clstn1Q9EPL2 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Clstn1Q9EPL2 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Clstn1Q9EPL2 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Clstn1Q9EPL2 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Clstn1Q9EPL2 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Clstn1Q9EPL2 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Clstn1Q9EPL2 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Clstn1Q9EPL2 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Clstn1Q9EPL2 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Clstn1Q9EPL2 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Clstn1Q9EPL2 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Clstn1Q9EPL2 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Clstn1Q9EPL2 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Clstn1Q9EPL2 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Clstn1Q9EPL2 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Clstn1Q9EPL2 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Clstn1Q9EPL2 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Clstn1Q9EPL2 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Clstn1Q9EPL2 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Clstn1Q9EPL2 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Clstn1Q9EPL2 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Clstn1Q9EPL2 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Clstn1Q9EPL2 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Clstn1Q9EPL2 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Clstn1Q9EPL2 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Clstn1Q9EPL2 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Clstn1Q9EPL2 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Clstn1Q9EPL2 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Clstn1Q9EPL2 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Clstn1Q9EPL2 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Clstn1Q9EPL2 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Clstn1Q9EPL2 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Clstn1Q9EPL2 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Clstn1Q9EPL2 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Clstn1Q9EPL2 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Clstn1Q9EPL2 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Clstn1Q9EPL2 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Clstn1Q9EPL2 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Clstn1Q9EPL2 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Clstn1Q9EPL2 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Clstn1Q9EPL2 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Clstn1Q9EPL2 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Clstn1Q9EPL2 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Clstn1Q9EPL2 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Clstn1Q9EPL2 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Clstn1Q9EPL2 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Clstn1Q9EPL2 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Clstn1Q9EPL2 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Clstn1Q9EPL2 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Clstn1Q9EPL2 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Clstn1Q9EPL2 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Clstn1Q9EPL2 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Clstn1Q9EPL2 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Clstn1Q9EPL2 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Clstn1Q9EPL2 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Clstn1Q9EPL2 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Clstn1Q9EPL2 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Clstn1Q9EPL2 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Clstn1Q9EPL2 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Clstn1Q9EPL2 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Clstn1Q9EPL2 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Clstn1Q9EPL2 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Clstn1Q9EPL2 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Clstn1Q9EPL2 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Clstn1Q9EPL2 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Clstn1Q9EPL2 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Clstn1Q9EPL2 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Clstn1Q9EPL2 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Clstn1Q9EPL2 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Clstn1Q9EPL2 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Clstn1Q9EPL2 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Clstn1Q9EPL2 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Clstn1Q9EPL2 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Clstn1Q9EPL2 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Clstn1Q9EPL2 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms