Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPB7

Gpr88, Probable G-protein coupled receptor 88, mousemouse

Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpr88Q9EPB7 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gpr88Q9EPB7 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gpr88Q9EPB7 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gpr88Q9EPB7 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gpr88Q9EPB7 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gpr88Q9EPB7 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gpr88Q9EPB7 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gpr88Q9EPB7 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gpr88Q9EPB7 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gpr88Q9EPB7 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gpr88Q9EPB7 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gpr88Q9EPB7 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gpr88Q9EPB7 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gpr88Q9EPB7 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gpr88Q9EPB7 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gpr88Q9EPB7 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gpr88Q9EPB7 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gpr88Q9EPB7 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gpr88Q9EPB7 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gpr88Q9EPB7 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gpr88Q9EPB7 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gpr88Q9EPB7 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gpr88Q9EPB7 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gpr88Q9EPB7 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gpr88Q9EPB7 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gpr88Q9EPB7 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gpr88Q9EPB7 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gpr88Q9EPB7 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gpr88Q9EPB7 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gpr88Q9EPB7 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gpr88Q9EPB7 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gpr88Q9EPB7 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gpr88Q9EPB7 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gpr88Q9EPB7 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gpr88Q9EPB7 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gpr88Q9EPB7 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gpr88Q9EPB7 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gpr88Q9EPB7 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gpr88Q9EPB7 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gpr88Q9EPB7 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gpr88Q9EPB7 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gpr88Q9EPB7 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gpr88Q9EPB7 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gpr88Q9EPB7 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gpr88Q9EPB7 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gpr88Q9EPB7 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gpr88Q9EPB7 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gpr88Q9EPB7 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gpr88Q9EPB7 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gpr88Q9EPB7 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gpr88Q9EPB7 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gpr88Q9EPB7 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gpr88Q9EPB7 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gpr88Q9EPB7 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gpr88Q9EPB7 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gpr88Q9EPB7 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gpr88Q9EPB7 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gpr88Q9EPB7 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gpr88Q9EPB7 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gpr88Q9EPB7 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gpr88Q9EPB7 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gpr88Q9EPB7 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gpr88Q9EPB7 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gpr88Q9EPB7 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gpr88Q9EPB7 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gpr88Q9EPB7 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gpr88Q9EPB7 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gpr88Q9EPB7 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gpr88Q9EPB7 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gpr88Q9EPB7 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gpr88Q9EPB7 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gpr88Q9EPB7 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gpr88Q9EPB7 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gpr88Q9EPB7 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gpr88Q9EPB7 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gpr88Q9EPB7 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpr88Q9EPB7 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpr88Q9EPB7 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpr88Q9EPB7 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpr88Q9EPB7 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpr88Q9EPB7 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpr88Q9EPB7 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpr88Q9EPB7 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpr88Q9EPB7 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpr88Q9EPB7 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpr88Q9EPB7 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpr88Q9EPB7 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpr88Q9EPB7 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpr88Q9EPB7 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpr88Q9EPB7 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpr88Q9EPB7 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpr88Q9EPB7 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpr88Q9EPB7 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpr88Q9EPB7 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpr88Q9EPB7 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpr88Q9EPB7 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpr88Q9EPB7 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpr88Q9EPB7 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpr88Q9EPB7 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpr88Q9EPB7 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms