Protein–RNA interactions for Protein: Q9EP79

Vmn1r52, Vomeronasal type-1 receptor 52, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r52Q9EP79 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r52Q9EP79 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r52Q9EP79 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r52Q9EP79 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r52Q9EP79 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r52Q9EP79 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r52Q9EP79 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r52Q9EP79 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r52Q9EP79 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r52Q9EP79 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r52Q9EP79 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r52Q9EP79 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r52Q9EP79 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r52Q9EP79 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r52Q9EP79 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r52Q9EP79 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r52Q9EP79 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r52Q9EP79 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r52Q9EP79 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r52Q9EP79 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r52Q9EP79 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r52Q9EP79 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r52Q9EP79 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r52Q9EP79 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r52Q9EP79 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r52Q9EP79 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r52Q9EP79 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r52Q9EP79 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r52Q9EP79 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r52Q9EP79 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r52Q9EP79 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r52Q9EP79 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r52Q9EP79 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r52Q9EP79 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r52Q9EP79 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r52Q9EP79 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r52Q9EP79 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r52Q9EP79 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r52Q9EP79 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r52Q9EP79 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r52Q9EP79 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r52Q9EP79 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r52Q9EP79 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r52Q9EP79 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r52Q9EP79 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r52Q9EP79 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r52Q9EP79 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r52Q9EP79 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r52Q9EP79 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r52Q9EP79 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r52Q9EP79 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r52Q9EP79 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r52Q9EP79 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r52Q9EP79 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r52Q9EP79 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r52Q9EP79 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r52Q9EP79 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r52Q9EP79 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r52Q9EP79 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r52Q9EP79 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r52Q9EP79 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r52Q9EP79 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r52Q9EP79 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r52Q9EP79 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r52Q9EP79 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r52Q9EP79 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r52Q9EP79 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r52Q9EP79 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r52Q9EP79 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r52Q9EP79 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r52Q9EP79 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r52Q9EP79 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r52Q9EP79 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r52Q9EP79 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r52Q9EP79 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r52Q9EP79 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r52Q9EP79 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r52Q9EP79 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r52Q9EP79 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r52Q9EP79 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r52Q9EP79 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r52Q9EP79 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r52Q9EP79 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r52Q9EP79 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r52Q9EP79 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r52Q9EP79 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r52Q9EP79 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r52Q9EP79 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r52Q9EP79 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r52Q9EP79 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r52Q9EP79 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r52Q9EP79 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r52Q9EP79 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r52Q9EP79 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r52Q9EP79 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r52Q9EP79 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r52Q9EP79 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r52Q9EP79 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r52Q9EP79 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r52Q9EP79 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms