Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCT5

Sdf2, Stromal cell-derived factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdf2Q9DCT5 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Sdf2Q9DCT5 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sdf2Q9DCT5 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sdf2Q9DCT5 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sdf2Q9DCT5 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sdf2Q9DCT5 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sdf2Q9DCT5 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sdf2Q9DCT5 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sdf2Q9DCT5 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sdf2Q9DCT5 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sdf2Q9DCT5 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sdf2Q9DCT5 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sdf2Q9DCT5 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sdf2Q9DCT5 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sdf2Q9DCT5 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sdf2Q9DCT5 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sdf2Q9DCT5 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sdf2Q9DCT5 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sdf2Q9DCT5 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sdf2Q9DCT5 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sdf2Q9DCT5 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sdf2Q9DCT5 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sdf2Q9DCT5 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sdf2Q9DCT5 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sdf2Q9DCT5 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sdf2Q9DCT5 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sdf2Q9DCT5 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sdf2Q9DCT5 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sdf2Q9DCT5 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sdf2Q9DCT5 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sdf2Q9DCT5 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sdf2Q9DCT5 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sdf2Q9DCT5 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sdf2Q9DCT5 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sdf2Q9DCT5 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sdf2Q9DCT5 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sdf2Q9DCT5 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sdf2Q9DCT5 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sdf2Q9DCT5 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sdf2Q9DCT5 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sdf2Q9DCT5 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sdf2Q9DCT5 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sdf2Q9DCT5 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sdf2Q9DCT5 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sdf2Q9DCT5 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sdf2Q9DCT5 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sdf2Q9DCT5 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sdf2Q9DCT5 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sdf2Q9DCT5 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sdf2Q9DCT5 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sdf2Q9DCT5 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sdf2Q9DCT5 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sdf2Q9DCT5 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sdf2Q9DCT5 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sdf2Q9DCT5 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sdf2Q9DCT5 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sdf2Q9DCT5 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sdf2Q9DCT5 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sdf2Q9DCT5 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sdf2Q9DCT5 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sdf2Q9DCT5 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sdf2Q9DCT5 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sdf2Q9DCT5 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Sdf2Q9DCT5 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sdf2Q9DCT5 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sdf2Q9DCT5 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sdf2Q9DCT5 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sdf2Q9DCT5 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sdf2Q9DCT5 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sdf2Q9DCT5 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sdf2Q9DCT5 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sdf2Q9DCT5 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sdf2Q9DCT5 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sdf2Q9DCT5 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Sdf2Q9DCT5 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sdf2Q9DCT5 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sdf2Q9DCT5 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sdf2Q9DCT5 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sdf2Q9DCT5 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sdf2Q9DCT5 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sdf2Q9DCT5 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sdf2Q9DCT5 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sdf2Q9DCT5 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sdf2Q9DCT5 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sdf2Q9DCT5 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sdf2Q9DCT5 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Sdf2Q9DCT5 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sdf2Q9DCT5 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sdf2Q9DCT5 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sdf2Q9DCT5 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sdf2Q9DCT5 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sdf2Q9DCT5 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sdf2Q9DCT5 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sdf2Q9DCT5 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sdf2Q9DCT5 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sdf2Q9DCT5 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Sdf2Q9DCT5 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sdf2Q9DCT5 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Sdf2Q9DCT5 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sdf2Q9DCT5 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms